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Enregistrement W7161853630 · doi:10.82308/43192

A weighted casebase framework for predicting risk in survival data

2023· dissertation· en· W7161853630 sur OpenAlexaboutno aff
Karina Kwan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods and Inference
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCovariateProportional hazards modelParametric statisticsSampling (signal processing)Logistic regressionHazardRegressionFunction (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Case-cohort studies are attractive for studying rare diseases where obtaining additional expensive or hard-to-access data, such as genomic sequencing, from a subset of participants is infeasible for the entire study cohort. In analyzing such studies, individual data points must be appropriately weighted to account for the biased case/control sampling. The Cox proportional hazards model is a popular semi-parametric method for analyzing survival data that provides step function risk estimates. A parametric alternative is the casebase framework, which uses finite sampling of person-moments together with logistic regression to estimate fully parametric hazard functions and smooth-in-time absolute risk functions. Unlike the Cox model, where well-tested methods exist to adjust for complex sampling designs, the casebase framework-based methods have not yet implemented weighted methods. This thesis proposes a weighted casebase framework that provides unbiased coefficient estimates and robust standard error estimates. A simulation study compares the performance of weighted Cox and casebase models. The proposed weighted analytic framework is then applied to model how cell-free DNA methylation (data obtained with the cfMeDIP-seq technology) affects risk of breast cancer in a (case-cohort) subset of individuals in the Ontario Health Study (OHS). The weighted framework performs similarly to weighted Cox models, and both are sensitive to covariate distributions and the size of the sampling fraction

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,047
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,069
Score d'incertitude au seuil0,961

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,047
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,206
Tête enseignante GPT0,471
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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