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Enregistrement W7161954285 · doi:10.82308/2285

The role of proprotein convertases in colon cancer progression

2012· dissertation· en· W7161954285 sur OpenAlexaboutno aff
Janet Kwan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColorectal cancerCancerFurinTumor progression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Les proprotéines convertases (PC) sont les enzymes protéolytiques impliquées dans la régulation des facteurs essentiels pour la croissance du cancer et sa progression. La littérature suggère que la surexpression de certaines PC contribue à la tumorigénèse, l'invasion et la métastase in vivo, mais la preuve du contraire existe aussi, où l'inhibition de PC promouvoit la migration cellulaire et les métastases pulmonaires. La difference entre ces résultats contradictoires pourrait déterminer l'effet global des PC spécifiques, résultant en cancers dont l'agressivité est soit augmentée ou diminuée. Les données préliminaires suggèrent que l'expression de plusieurs PC et une protéine chaperon 7B2 est altéré dans les métastases hépatiques des cancers colorecteaux humain (CRC), et nous faisons l'hypothèse que les niveaux de PC actifs dans le CRC primaire pourrait prédire la progression et la formation de métastases. Pour déterminer l'effet des PC (PACE4, PC5 / 6, PC7, furine, PC1 / 3) et 7B2 dans les cellules métastatiques du cancer du côlon, la lignée HT-29 transfectée avec le shRNA des gènes mentionnées a été étudiée. Les différences phénotypiques des lignées cellulaires dont l'expression des PC et 7B2 a été supprimé ont été évaluées pour la prolifération en utilisant la détection de Ki67; l'apoptose, en utilisant l'annexine V et l'analyse de l'activité caspases; et la croissance ancrage-indépendante, à l'aide de culture en agar mou. Comparaison entre les lignées HT-29, et ceux qui expriment LKO (vecteur vide), NT (séquence brouillée), hPACE4, hPC5/6, hPC7, h7B2, hFur et hPC1/3 n'ont montré aucune différence dans l'expression de Ki67 (p = 0,937) et annexine V (0.838). Il y avait des différences significatives dans l'activité des caspases (P = 0,001) et la croissance de colonies en agar mou (P = 0,001). Une analyse plus poussée a révélé une activité des caspases réduite dans les cellules qui exprimaient hPC5/6 (P = 0,032) et élevée chez les cellules exprimant hFur (P = 0,032). En plus, les cellules qui exprimaient hPC5/6 ont montré un plus grand potentiel de croissance en agar mou (P = 0,001) comparativement au contrôle. Afin de déterminer un profil d'expression PC dans les tissus humains, les données de 45 patients consentants ayant subi une chirurgie pour un cancer primaire du côlon en 2004 au MUHC (McGill University Health Centre), ont été recueillies. Un tissu microarray (TMA) des spécimens chirurgicaux - comprenant le côlon (tumeur et normal), les ganglions lymphatiques (tumeur, le cas échéant, et normal) et le cas échéant, le foie (tumeur et normal) - a été construit. Les colorations immunohistochimiques pour les PC1, PC2, PACE4, PC5 /6, PC7, furine et 7B2 sera effectuées; VEGF, MLH1 et MSH2 (marqueurs connus de mauvais pronostic pour CRC) seront également colorés et corrélés avec le pronostic des patients. Les études in vitro démontrent un comportement modifié des cellules CRC selon le profil de PC modifié. La suppression des niveaux de PC5/6 diminue l'activité apoptotique et augmente la croissance en agar mou. Cela peut suggérer que PC5/6 a un effet protecteur contre la charge tumorale locale. D'autres études évaluant le potentiel invasif et métastatique sont nécessaires. De plus, avec une approche productive, la disponibilité d'une TMA permettra de transposer les résultats des expériences actuelles et futures à la gestion ciblée et efficace des patients qui souffrent de cancer colorectal.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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