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Record W7161954285 · doi:10.82308/2285

The role of proprotein convertases in colon cancer progression

2012· dissertation· en· W7161954285 on OpenAlexaboutno aff
Janet Kwan

Bibliographic record

Venuenot available
Typedissertation
Languageen
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsColorectal cancerCancerFurinTumor progression

Abstract

fetched live from OpenAlex

Les proprotéines convertases (PC) sont les enzymes protéolytiques impliquées dans la régulation des facteurs essentiels pour la croissance du cancer et sa progression. La littérature suggère que la surexpression de certaines PC contribue à la tumorigénèse, l'invasion et la métastase in vivo, mais la preuve du contraire existe aussi, où l'inhibition de PC promouvoit la migration cellulaire et les métastases pulmonaires. La difference entre ces résultats contradictoires pourrait déterminer l'effet global des PC spécifiques, résultant en cancers dont l'agressivité est soit augmentée ou diminuée. Les données préliminaires suggèrent que l'expression de plusieurs PC et une protéine chaperon 7B2 est altéré dans les métastases hépatiques des cancers colorecteaux humain (CRC), et nous faisons l'hypothèse que les niveaux de PC actifs dans le CRC primaire pourrait prédire la progression et la formation de métastases. Pour déterminer l'effet des PC (PACE4, PC5 / 6, PC7, furine, PC1 / 3) et 7B2 dans les cellules métastatiques du cancer du côlon, la lignée HT-29 transfectée avec le shRNA des gènes mentionnées a été étudiée. Les différences phénotypiques des lignées cellulaires dont l'expression des PC et 7B2 a été supprimé ont été évaluées pour la prolifération en utilisant la détection de Ki67; l'apoptose, en utilisant l'annexine V et l'analyse de l'activité caspases; et la croissance ancrage-indépendante, à l'aide de culture en agar mou. Comparaison entre les lignées HT-29, et ceux qui expriment LKO (vecteur vide), NT (séquence brouillée), hPACE4, hPC5/6, hPC7, h7B2, hFur et hPC1/3 n'ont montré aucune différence dans l'expression de Ki67 (p = 0,937) et annexine V (0.838). Il y avait des différences significatives dans l'activité des caspases (P = 0,001) et la croissance de colonies en agar mou (P = 0,001). Une analyse plus poussée a révélé une activité des caspases réduite dans les cellules qui exprimaient hPC5/6 (P = 0,032) et élevée chez les cellules exprimant hFur (P = 0,032). En plus, les cellules qui exprimaient hPC5/6 ont montré un plus grand potentiel de croissance en agar mou (P = 0,001) comparativement au contrôle. Afin de déterminer un profil d'expression PC dans les tissus humains, les données de 45 patients consentants ayant subi une chirurgie pour un cancer primaire du côlon en 2004 au MUHC (McGill University Health Centre), ont été recueillies. Un tissu microarray (TMA) des spécimens chirurgicaux - comprenant le côlon (tumeur et normal), les ganglions lymphatiques (tumeur, le cas échéant, et normal) et le cas échéant, le foie (tumeur et normal) - a été construit. Les colorations immunohistochimiques pour les PC1, PC2, PACE4, PC5 /6, PC7, furine et 7B2 sera effectuées; VEGF, MLH1 et MSH2 (marqueurs connus de mauvais pronostic pour CRC) seront également colorés et corrélés avec le pronostic des patients. Les études in vitro démontrent un comportement modifié des cellules CRC selon le profil de PC modifié. La suppression des niveaux de PC5/6 diminue l'activité apoptotique et augmente la croissance en agar mou. Cela peut suggérer que PC5/6 a un effet protecteur contre la charge tumorale locale. D'autres études évaluant le potentiel invasif et métastatique sont nécessaires. De plus, avec une approche productive, la disponibilité d'une TMA permettra de transposer les résultats des expériences actuelles et futures à la gestion ciblée et efficace des patients qui souffrent de cancer colorectal.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.002
Threshold uncertainty score0.003

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.006
GPT teacher head0.284
Teacher spread0.278 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2012
Admission routes1
Has abstractyes

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