Host factors associated with HPV infection in Inuit Women of Northern Quebec
Notice bibliographique
Résumé
Contexte : Le complexe d'histocompatibilité (HLA) humain, un ensemble de gènes engagés dans l'identification d'antigènes étrangers et l'activation du système immunitaire, pourrait être un cofacteur des infections au VPH. Objectifs :Déterminer les fréquences des allèles, haplotypes et génotypes HLA au sein d'une cohorte de femmes inuites du Nunavik, au Québec. Cette recherche portera sur l'association entre ces allèles et haplotypes et la prévalence, l'incidence, et la persistance du VPH, de même que les infections multiples au VPH et les lésions malpighiennes intraépithéliales(SIL).Méthodes :Une cohorte composée de 548 femmes inuites s'étant présentées pour un examen de routine et vivant dans quatre communautés différentes du Nunavik a été constituée (2002-2010). Des échantillons de leur col utérin ont été prélevés à chaque visite et ont fait l'objet d'un test de dépistage d'ADN du VPH. Les génotypes du VPH ont été classés par potentiel oncogène et par espèces alphapapillomavirus. Les allèles HLA ont été typés à l'aide d'ADN provenant des échantillons de cols utérins prélevés lors de l'entré au sein de la cohorte. Tous les rapports de probabilité et taux bruts ont été ajustés en fonction de l'âge. Résultats :Les allèles HLA de catégorie I et catégorie II les plus courants sont respectivement les HLA-E*0103 (66,4 %) et HLA-DQB1*03 (94,2 %). Trois allèles HLA-G étaient prévalents au sein de cette population : HLA-G*010401 (50,4 %), HLA-G*010101 (31,4 %) et HLA-G*010102 (15,2 %). Le HLA-G*010102 était associé à un risque significativement réduit de prévalence générale du VPH (RC=0,64 95 % IC=0,42-0,98) et à un faible risque de prévalence de VPH à faible risque (RC=0,37 95 % IC=0,16-0,83). Le HLA-G*010101 et ses génotypes homozygotes et hétérozygotes étaient associés à un risque augmenté de groupes alpha 1 et 3 à faible risque. Le génotype homozygote HLA-G*010401 était associé à un risque réduit d'infection de groupe alpha 3 à faible risque. Aucun allèle, haplotype ni génotype HLA n'était associé de manière significative à la persistance du VPH. L'allèle HLA-DRB1*13 était associé à un risque réduit de toute lésion intraépithéliale malpighienne (SIL) ou de toute lésion intraépithéliale malpighienne de bas grade (LGSIL). Conclusions :La distribution des allèles et haplotypes HLA au sein d'une population du Nunavik, au Québec, diffère de celle observée au sein d'autres populations canadiennes, comprenant des femmes d'origines ethniques diverses. Plusieurs allèles (G*010101, G*010102 et G*010401) étaient associés à la prévalence du VPH au cours d'une période donnée, mais aucun n'était associé de façon significative à la persistance du VPH.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».