Host factors associated with HPV infection in Inuit Women of Northern Quebec
Bibliographic record
Abstract
Contexte : Le complexe d'histocompatibilité (HLA) humain, un ensemble de gènes engagés dans l'identification d'antigènes étrangers et l'activation du système immunitaire, pourrait être un cofacteur des infections au VPH. Objectifs :Déterminer les fréquences des allèles, haplotypes et génotypes HLA au sein d'une cohorte de femmes inuites du Nunavik, au Québec. Cette recherche portera sur l'association entre ces allèles et haplotypes et la prévalence, l'incidence, et la persistance du VPH, de même que les infections multiples au VPH et les lésions malpighiennes intraépithéliales(SIL).Méthodes :Une cohorte composée de 548 femmes inuites s'étant présentées pour un examen de routine et vivant dans quatre communautés différentes du Nunavik a été constituée (2002-2010). Des échantillons de leur col utérin ont été prélevés à chaque visite et ont fait l'objet d'un test de dépistage d'ADN du VPH. Les génotypes du VPH ont été classés par potentiel oncogène et par espèces alphapapillomavirus. Les allèles HLA ont été typés à l'aide d'ADN provenant des échantillons de cols utérins prélevés lors de l'entré au sein de la cohorte. Tous les rapports de probabilité et taux bruts ont été ajustés en fonction de l'âge. Résultats :Les allèles HLA de catégorie I et catégorie II les plus courants sont respectivement les HLA-E*0103 (66,4 %) et HLA-DQB1*03 (94,2 %). Trois allèles HLA-G étaient prévalents au sein de cette population : HLA-G*010401 (50,4 %), HLA-G*010101 (31,4 %) et HLA-G*010102 (15,2 %). Le HLA-G*010102 était associé à un risque significativement réduit de prévalence générale du VPH (RC=0,64 95 % IC=0,42-0,98) et à un faible risque de prévalence de VPH à faible risque (RC=0,37 95 % IC=0,16-0,83). Le HLA-G*010101 et ses génotypes homozygotes et hétérozygotes étaient associés à un risque augmenté de groupes alpha 1 et 3 à faible risque. Le génotype homozygote HLA-G*010401 était associé à un risque réduit d'infection de groupe alpha 3 à faible risque. Aucun allèle, haplotype ni génotype HLA n'était associé de manière significative à la persistance du VPH. L'allèle HLA-DRB1*13 était associé à un risque réduit de toute lésion intraépithéliale malpighienne (SIL) ou de toute lésion intraépithéliale malpighienne de bas grade (LGSIL). Conclusions :La distribution des allèles et haplotypes HLA au sein d'une population du Nunavik, au Québec, diffère de celle observée au sein d'autres populations canadiennes, comprenant des femmes d'origines ethniques diverses. Plusieurs allèles (G*010101, G*010102 et G*010401) étaient associés à la prévalence du VPH au cours d'une période donnée, mais aucun n'était associé de façon significative à la persistance du VPH.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.002 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.003 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".