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Enregistrement W7161991264 · doi:10.82308/2061

HPV variants in Inuit women from Nunavik, Quebec

2015· dissertation· en· W7161991264 sur OpenAlexaboutno aff
Barbara Gauthier

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPopulationHuman immunodeficiency virus (HIV)SidaResearch methodology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Contexte: Les communautés Inuites du Nord du Québec ont des taux élevés d’infection par le virus du papillome humain (VPH), de cancer du col utérin, et de la mortalité liée au cancer du col utérin par rapport à la population canadienne. Les types de VPH à risque élevé (HR) peuvent être classés en variantes intra typique basé sur la séquence génétique. Des différences de séquences particulières peuvent affecter le temps d’élimination de l’infection (clairance) et donc son potentiel oncogénique. Il y a peu d'informations sur la présence de variantes intra typique se trouvant dans les régions circumpolaires. Il n’y a aussi aucune recherche antérieure sur l'association entre différentes variantes intra typique et l'infection persistante chez les femmes Inuit.Méthodes: 749 femmes Inuits entre les âges de 15 à 69 du Nunavik avaient l'ADN du VPH recueillies avec des échantillons de Pap opportuniste entre les années 2002 à 2010. Les échantillons HR-VPH ont été séquencés afin de déterminer la variante intra typique. Les différentes lignées de variantes et les variantes présentes ont été décrites et comparées à une population circumpolaire similaire. La régression logistique et de modèles de Cox proportionnels ont été utilisés pour évaluer l'association entre différentes séquences et l'infection persistante.Résultats: Il y avait 187 femmes qui étaient positifs pour les VPH- 16, 18, 31, 33, 35, 45, 52, 56, ou 58 au cours du suivi. Il y avait 5 différentes variantes de VPH-16, qui tous étaient de la lignée européenne, parmi les 57 femmes positives pour ce type. Il y avait 8 différentes variantes de VPH-18 et tous étaient de lignage européen (n = 21). La majorité des échantillons de VPH-31 (n = 52) étaient de la lignée B. Le risque ajusté selon l'âge d’éliminer une infection était 3,13 fois plus élevé (95% CI 1,10 à 8,97) chez les personnes infectées par le VPH-16 non-prototypiques par rapport à ceux qui sont infectés avec des variantes prototypiques. L'association inverse a été observée avec VPH-52.Conclusion: Il semble y avoir moins de diversité au Nunavik que dans une autre région circumpolaire du Canada car aucune variante non européenne ne fut trouvée. Cette étude démontre que la plupart des variantes sont regroupés en une seule lignée pour chaque type de VPH. La variation intra typique pourrait potentiellement être utilisée comme un prédicteur de la clairance virale pour certains types de HR-VPH dans cette population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,055

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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