MétaCan
Menu
← Back to cohort
Record W7161991264 · doi:10.82308/2061

HPV variants in Inuit women from Nunavik, Quebec

2015· dissertation· en· W7161991264 on OpenAlexaboutno aff
Barbara Gauthier

Bibliographic record

Venuenot available
Typedissertation
Languageen
FieldMedicine
TopicCervical Cancer and HPV Research
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsPopulationHuman immunodeficiency virus (HIV)SidaResearch methodology

Abstract

fetched live from OpenAlex

Contexte: Les communautés Inuites du Nord du Québec ont des taux élevés d’infection par le virus du papillome humain (VPH), de cancer du col utérin, et de la mortalité liée au cancer du col utérin par rapport à la population canadienne. Les types de VPH à risque élevé (HR) peuvent être classés en variantes intra typique basé sur la séquence génétique. Des différences de séquences particulières peuvent affecter le temps d’élimination de l’infection (clairance) et donc son potentiel oncogénique. Il y a peu d'informations sur la présence de variantes intra typique se trouvant dans les régions circumpolaires. Il n’y a aussi aucune recherche antérieure sur l'association entre différentes variantes intra typique et l'infection persistante chez les femmes Inuit.Méthodes: 749 femmes Inuits entre les âges de 15 à 69 du Nunavik avaient l'ADN du VPH recueillies avec des échantillons de Pap opportuniste entre les années 2002 à 2010. Les échantillons HR-VPH ont été séquencés afin de déterminer la variante intra typique. Les différentes lignées de variantes et les variantes présentes ont été décrites et comparées à une population circumpolaire similaire. La régression logistique et de modèles de Cox proportionnels ont été utilisés pour évaluer l'association entre différentes séquences et l'infection persistante.Résultats: Il y avait 187 femmes qui étaient positifs pour les VPH- 16, 18, 31, 33, 35, 45, 52, 56, ou 58 au cours du suivi. Il y avait 5 différentes variantes de VPH-16, qui tous étaient de la lignée européenne, parmi les 57 femmes positives pour ce type. Il y avait 8 différentes variantes de VPH-18 et tous étaient de lignage européen (n = 21). La majorité des échantillons de VPH-31 (n = 52) étaient de la lignée B. Le risque ajusté selon l'âge d’éliminer une infection était 3,13 fois plus élevé (95% CI 1,10 à 8,97) chez les personnes infectées par le VPH-16 non-prototypiques par rapport à ceux qui sont infectés avec des variantes prototypiques. L'association inverse a été observée avec VPH-52.Conclusion: Il semble y avoir moins de diversité au Nunavik que dans une autre région circumpolaire du Canada car aucune variante non européenne ne fut trouvée. Cette étude démontre que la plupart des variantes sont regroupés en une seule lignée pour chaque type de VPH. La variation intra typique pourrait potentiellement être utilisée comme un prédicteur de la clairance virale pour certains types de HR-VPH dans cette population.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: Observational
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.026
Threshold uncertainty score0.055

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.002
Science and technology studies0.0020.001
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0010.001
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0030.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.030
GPT teacher head0.363
Teacher spread0.333 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2015
Admission routes1
Has abstractyes

Explore more

Same topicCervical Cancer and HPV Research→French-language works237,207→