Development of an active peptide derived from the Sacsin J domain and identifying new functions of Sacsin in ARSACS models
Notice bibliographique
Résumé
L'ataxie spastique récessive autosomique de Charlevoix Saguenay (ARSACS) est causée par des mutations de perte de fonction dans le gène SACS, qui code pour sacsin, une protéine géante de 520 kDa. On sait peu de choses sur la fonction de la sacsin, une caractéristique clé est la formation de faisceaux anormaux de filaments intermédiaires (IF), y compris les neurofilaments (NF) en son absence. Le domaine J (SacsJ) est un cochaperon qui interagit avec les chaperons Hsp70 ; ses protéines clientes sont inconnues, nous avons donc cherché à déterminer le rôle de ce domaine. L'identification par spectrométrie de masse des partenaires de liaison du domaine SacsJ, qui résolvent l’agglomération pathologique de NF in vitro, montre que la protéine Rab1b est un interacteur abondant impliqué dans le trafic des organelles. Rab1 est responsable de la régulation des activités de trafic entre les vésicules autophagiques ER, Golgi et ATG9, dont les morphologies et les distributions cellulaires sont affectées par le manque de sacsin dans les motoneurones en culture et in vivo. Parce que l'IF joue un rôle dans la régulation des morphologies de ces organelles, la ligné cellulaire adénocarcinomes SW13- knock-out pour la sacsin et dépourvu d'IF a été utilisé pour démontrer l'indépendance du compactage de Golgi par rapport à l'agglomération des IF. Dans SW13- Sacs-/-, l'expression des domaines SacsJ, H33Q (mutant DNAJ incompétent pour la liaison Hsp70) et Ubl augmente la localisation de Rab1 dans le réticulum endoplasmique (RE). Nos données démontrent pour la première fois le partenaire d'interaction du domaine DNAJ et le rôle de SacsJ et d'autres domaines sacsin dans le trafic RE/Golgi indépendamment de la protéine IF
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».