Development of an active peptide derived from the Sacsin J domain and identifying new functions of Sacsin in ARSACS models
Bibliographic record
Abstract
L'ataxie spastique récessive autosomique de Charlevoix Saguenay (ARSACS) est causée par des mutations de perte de fonction dans le gène SACS, qui code pour sacsin, une protéine géante de 520 kDa. On sait peu de choses sur la fonction de la sacsin, une caractéristique clé est la formation de faisceaux anormaux de filaments intermédiaires (IF), y compris les neurofilaments (NF) en son absence. Le domaine J (SacsJ) est un cochaperon qui interagit avec les chaperons Hsp70 ; ses protéines clientes sont inconnues, nous avons donc cherché à déterminer le rôle de ce domaine. L'identification par spectrométrie de masse des partenaires de liaison du domaine SacsJ, qui résolvent l’agglomération pathologique de NF in vitro, montre que la protéine Rab1b est un interacteur abondant impliqué dans le trafic des organelles. Rab1 est responsable de la régulation des activités de trafic entre les vésicules autophagiques ER, Golgi et ATG9, dont les morphologies et les distributions cellulaires sont affectées par le manque de sacsin dans les motoneurones en culture et in vivo. Parce que l'IF joue un rôle dans la régulation des morphologies de ces organelles, la ligné cellulaire adénocarcinomes SW13- knock-out pour la sacsin et dépourvu d'IF a été utilisé pour démontrer l'indépendance du compactage de Golgi par rapport à l'agglomération des IF. Dans SW13- Sacs-/-, l'expression des domaines SacsJ, H33Q (mutant DNAJ incompétent pour la liaison Hsp70) et Ubl augmente la localisation de Rab1 dans le réticulum endoplasmique (RE). Nos données démontrent pour la première fois le partenaire d'interaction du domaine DNAJ et le rôle de SacsJ et d'autres domaines sacsin dans le trafic RE/Golgi indépendamment de la protéine IF
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.001 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.000 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.001 | 0.001 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.002 | 0.001 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".