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Enregistrement W7162028245 · doi:10.82308/9080

Social, genetic and behavioural risk factors of head and neck cancers - elucidating causal pathways

2017· dissertation· en· W7162028245 sur OpenAlexaboutno aff
Akhil Soman Thekke Purakkal

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlutathione Transferases and Polymorphisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPopulationHead and neckRisk factorMedical screening

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction : La position socioéconomique (PSE), de multiples variantes dans les gènes encodant les enzymes Cytochrome P450 (CYP) et Glutathione S-transferase (GST), et les comportements à risque liés au tabac et à l'alcool ont été largement étudiés en relation avec le risque de carcinome épidermoïde de la tête et du cou (CETC). Bien qu'une accumulation de PSE désavantageuse au cours de la vie ait été associée à un risque accru de cancer de la bouche, cette association n'a pas été explorée à travers la lentille de multiples modèles du parcours de vie dans une seule étude. Les preuves de l'effet de multiples variantes génétiques dans les gènes CYP1A1, CYP2E1, CYP2A6, CYP2D6, GSTP1 et GSTM1 sur le CETC sont conflictuelles est leur effet, indépendamment ou en interaction avec la consommation de tabac, n'a pas été documenté chez la population canadienne caucasienne. En outre, l'utilisation de tabac et d'alcool pourrait interagir ainsi que servir de médiateur de l'effet de variantes génétiques dans CYP2A6 et ADH1B respectivement sur le CETC. Cependant, leurs effets, selon une combinaison de médiation et d'interaction avec les comportements à risque associés, n'ont pas encore été quantifiés. S'attaquer à ces lacunes dans les connaissances a le potentiel d'élucider les mécanismes causaux sous-tendant la relation entre ces facteurs de risque sociaux, génétiques et comportementaux, et le CETC. Méthodes : Les données de cette thèse ont été tirées des sites indien et canadien d'une étude internationale multicentrique cas-témoin réalisée dans les hôpitaux : l'étude Head and Neck Cancer (HeNCe) Life. De l'information sur la PSE dans l'enfance (0-16 ans), la vie de jeune adulte (17-30 ans) et d'adulte (plus de 30 ans), et sur les comportements à risque liés au tabac et à l'alcool tout au long de la vie a été recueillie à l'aide d'entrevues et d'une technique de grille de vie. L'estimation de l'association PSE-cancer de la bouche a utilisé des données sur 350 cas incidents de cancer de la bouche et 371 témoins appariés par fréquence selon l'âge et le sexe recrutés dans deux hôpitaux importants à Kozhikode, Kerala, Inde entre 2008 et 2012. La PSE et les facteurs de confusion ont été considérés comme des variables variant dans le temps. L'estimation de l'effet total des variantes génétiques et de leurs effets d'interaction avec de multiples niveaux de paquets-années (pack-years) de tabac a utilisé des données sur 389 cas incidents de CETC et 429 témoins appariés par fréquence selon l'âge et le sexe recrutés dans des hôpitaux de Montréal, Canada. Un sous-échantillon de ces données sur les fumeurs et les consommateurs d'alcool a été utilisé pour estimer les mécanismes causaux entre les variantes génétiques de CYP2A6, ADH1B et le CETC définis par la médiation et l'interaction avec les fréquences d'utilisation de tabac et d'alcool. Des techniques analytiques décrites dans le cadre contrefactuel causal telles que les modèles structurels marginaux pondérés par inverse de probabilité (inverse-probability weighted marginal structural models), et la médiation et les techniques de décomposition à quatre niveaux (mediation and four-way decomposition techniques) ont été utilisées pour dériver des estimations d'effet causal.Résultats : La PSE (avantageuse vs désavantageuse) dans l'enfance et dans la vie de jeune adulte étaient associées avec le risque de cancer de la bouche [rapports de cotes (odds ratios, RC)=2.76, intervalle de confiance (IC) à 95%: 1.99, 3.81) et (RC=1.84, IC à 95%: 1.21, 2.79), respectivement]. De plus, les participants qui avaient une PSE désavantageuse (vs avantageuse) durant les trois périodes de vie avaient un risque accru de cancer de la bouche [RC=4.86, IC à 95%: 2.61, 9.06]. Le modèle de mobilité sociale de l'enfance à la vie de jeune adulte et les trajectoires du parcours de vie dans l'ensemble indiquaient une forte influence de l'exposition à une PSE désavantageuse dans l'enfance sur le risque de cancer de la bouche.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,476
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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Résumé présentoui

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