Social, genetic and behavioural risk factors of head and neck cancers - elucidating causal pathways
Bibliographic record
Abstract
Introduction : La position socioéconomique (PSE), de multiples variantes dans les gènes encodant les enzymes Cytochrome P450 (CYP) et Glutathione S-transferase (GST), et les comportements à risque liés au tabac et à l'alcool ont été largement étudiés en relation avec le risque de carcinome épidermoïde de la tête et du cou (CETC). Bien qu'une accumulation de PSE désavantageuse au cours de la vie ait été associée à un risque accru de cancer de la bouche, cette association n'a pas été explorée à travers la lentille de multiples modèles du parcours de vie dans une seule étude. Les preuves de l'effet de multiples variantes génétiques dans les gènes CYP1A1, CYP2E1, CYP2A6, CYP2D6, GSTP1 et GSTM1 sur le CETC sont conflictuelles est leur effet, indépendamment ou en interaction avec la consommation de tabac, n'a pas été documenté chez la population canadienne caucasienne. En outre, l'utilisation de tabac et d'alcool pourrait interagir ainsi que servir de médiateur de l'effet de variantes génétiques dans CYP2A6 et ADH1B respectivement sur le CETC. Cependant, leurs effets, selon une combinaison de médiation et d'interaction avec les comportements à risque associés, n'ont pas encore été quantifiés. S'attaquer à ces lacunes dans les connaissances a le potentiel d'élucider les mécanismes causaux sous-tendant la relation entre ces facteurs de risque sociaux, génétiques et comportementaux, et le CETC. Méthodes : Les données de cette thèse ont été tirées des sites indien et canadien d'une étude internationale multicentrique cas-témoin réalisée dans les hôpitaux : l'étude Head and Neck Cancer (HeNCe) Life. De l'information sur la PSE dans l'enfance (0-16 ans), la vie de jeune adulte (17-30 ans) et d'adulte (plus de 30 ans), et sur les comportements à risque liés au tabac et à l'alcool tout au long de la vie a été recueillie à l'aide d'entrevues et d'une technique de grille de vie. L'estimation de l'association PSE-cancer de la bouche a utilisé des données sur 350 cas incidents de cancer de la bouche et 371 témoins appariés par fréquence selon l'âge et le sexe recrutés dans deux hôpitaux importants à Kozhikode, Kerala, Inde entre 2008 et 2012. La PSE et les facteurs de confusion ont été considérés comme des variables variant dans le temps. L'estimation de l'effet total des variantes génétiques et de leurs effets d'interaction avec de multiples niveaux de paquets-années (pack-years) de tabac a utilisé des données sur 389 cas incidents de CETC et 429 témoins appariés par fréquence selon l'âge et le sexe recrutés dans des hôpitaux de Montréal, Canada. Un sous-échantillon de ces données sur les fumeurs et les consommateurs d'alcool a été utilisé pour estimer les mécanismes causaux entre les variantes génétiques de CYP2A6, ADH1B et le CETC définis par la médiation et l'interaction avec les fréquences d'utilisation de tabac et d'alcool. Des techniques analytiques décrites dans le cadre contrefactuel causal telles que les modèles structurels marginaux pondérés par inverse de probabilité (inverse-probability weighted marginal structural models), et la médiation et les techniques de décomposition à quatre niveaux (mediation and four-way decomposition techniques) ont été utilisées pour dériver des estimations d'effet causal.Résultats : La PSE (avantageuse vs désavantageuse) dans l'enfance et dans la vie de jeune adulte étaient associées avec le risque de cancer de la bouche [rapports de cotes (odds ratios, RC)=2.76, intervalle de confiance (IC) à 95%: 1.99, 3.81) et (RC=1.84, IC à 95%: 1.21, 2.79), respectivement]. De plus, les participants qui avaient une PSE désavantageuse (vs avantageuse) durant les trois périodes de vie avaient un risque accru de cancer de la bouche [RC=4.86, IC à 95%: 2.61, 9.06]. Le modèle de mobilité sociale de l'enfance à la vie de jeune adulte et les trajectoires du parcours de vie dans l'ensemble indiquaient une forte influence de l'exposition à une PSE désavantageuse dans l'enfance sur le risque de cancer de la bouche.
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How this classification was reachedexpand
Full frame distilled prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.
Codex and Gemma teacher scores by category
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.000 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.000 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one teacher head, not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".