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Enregistrement W7162078266 · doi:10.82308/45479

Impact of UV disinfection on the virulence and antibiotic resistance gene profile of Escherichia coli in municipal wastewater and its receiving waters

2013· dissertation· en· W7162078266 sur OpenAlexaboutno aff
Melanie Yip Woon Sun

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulenceEscherichia coliAntibiotic resistancePathogenic Escherichia coliWastewaterPopulationAntibioticsBacteriaPathogenic bacteriaFeces

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fecal water contaminations have been known to cause severe disease outbreaks throughout the world, thus proper wastewater treatment can help to avoid them. Escherichia coli (E. coli) is a well-known microorganism that flourishes in the gut of warm-blooded animals and can cause disease, such as diarrhoea, urinary tract infection, dysentery-like illness, haemorrhagic colitis and neonatal meningitis. Previous studies have shown that the virulence gene profile of E. coli can accurately predict its in vivo pathogenicity in animal models. E. coli in municipal wastewaters was therefore used in this study as a model pathogenic microorganism to examine the effects of activated sludge and UV disinfection on its virulence and its antibiotic resistance gene profile. DNA microarrays were used to conduct genotyping. The virulence and antibiotic resistance gene profile of E. coli in the receiving waters impacted by the treatment plant were also investigated.E. coli isolates (540 in total) were collected in May 2011 from 6 locations at the Skyway Wastewater Treatment Plant (Burlington, Ontario) and the Hamilton Harbour, which is the receiving water body for the treatment plant's effluent. Samples were also collected from an avian-contaminated area to investigate a possible relationship between the pollution in the harbour and the pollution by wild birds and municipal effluents. Results showed that although UV disinfection decreased the E. coli counts by more than 2 logs, the percentage of E. coli with a pathogenic genotype in the surviving population had increased by almost 10%. The activated sludge system proliferated virulence and antibiotic resistance genes. 22.5% of all isolates were uropathogenic E. coli 6.7% incomplete extraintestinal pathogenic E. coli and 1.7% shiga-toxin associated E. coli. No strong correlation was found between the genotypes found in the treatment plant's effluent and the harbour samples. 40% of the treatment plant's isolates carried some antibiotic resistance genes with a higher proportion of isolates carrying multiple antibiotic resistance genes. The majority of the isolates (70%) did not carry any antibiotic resistance (AMR) genes. Most of the AMR genes detected corresponded to beta-lactams (20%), aminoglycosides (19.6%), tetracyclines (19.1%), phenicols (12.6%) and trimethoprim (11.5%). Also, results demonstrated that UV decreased (by 9%) the percentage of isolates that had multiple antibiotic resistance genes, while activated sludge increased this percentage (by 5%). No statistically significant difference was found in the distribution of the antibiotic resistance genes in the harbour samples or between the pathotypes and the presence of antibiotic resistance genes in any samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
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