Characterization of pyrene degradation by Mycobacterium sp. strain S65
Notice bibliographique
Résumé
The microbial degradation of pyrene, a 4-ring polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH), has been elucidated with the increasing number of pyrene-degrading bacteria that have been isolated in recent years. A pyrene degrading bacterium identified as Mycobacterium sp. strain S65, was isolated from a jet-fuel contaminated site in Sept-Iles, northern Quebec, Canada. S65 utilized pyrene, phenanthrene, and fluoranthene as sole carbon and energy sources, but did not degrade naphthalene, anthracene, and fluorene. Pyrene mineralization was enhanced by adding benz[a]anthracene, benzy[a]pyrene, or phenanthrene as cosubstrates. When added to PAH contaminated soil as a potential bioaugmentation agent, S65 did not appear to survive well, nor was it effective at degrading PAHs under these conditions. Pyrene catabolic genes in S65 were partially characterized by Southern hybridization using a probe constructed from the naphthalene inducible pyrene dioxygenase gene, nidA, from the pyrene-degrading bacterium, Mycobacterium sp. strain PYR-1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».