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Enregistrement W7162111802 · doi:10.82308/43059

Molecular mechanisms underlying the pathogenesis of Leigh Syndrome French Canadian

2019· dissertation· en· W7162111802 sur OpenAlexaboutno aff
Shamisa Honarmand

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPentatricopeptide repeatMitochondrial DNAAnimal modelMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Des mitochondries pleinement fonctionnelles sont essentielles au maintien de la physiologie cellulaire, notamment grâce à la génération d'ATP par la voie de la phosphorylation oxydative. Une dysfonction mitochondriale peut être à l'origine de certaines maladies neurodégénératives telles que le syndrome de Leigh franco-canadien (LSFC), un trouble précoce autosomique récessif répandu dans une région du nord du Québec, le Saguenay Lac-Saint-Jean. Le gène responsable, situé sur le chromosome 2, code pour la protéine mitochondriale LRPPRC, riche en leucine et motif pentatricopeptide (PPR). La fonction exacte de LRPPRC reste à être élucidée. Cependant, des études in vivo révèlent que LRPPRC forme un complexe avec la protéine de liaison à l'ARN SLIRP, et que ce complexe est nécessaire à la stabilité de l'ARNm mitochondrial. Il est intéressant de constater qu'il existe une forte hétérogénéité du déficit mitochondrial selon les tissus, c'est ce que nous avons observé chez un patient porteur de la mutation de novo (p. A354V).Cette thèse porte sur l'étude de la fonction mitochondriale chez des souris invalidées pour le gène LRPPRC au niveau hépatique. Nous avons démontré que la perte de LRPPRC entraîne un retard de croissance généralisé et des caractéristiques histologiques typiques d'une l'hépato-pathie mitochondriale. Au niveau moléculaire, l'absence LRPPRC entraîne la déstabilisation d'un certain nombre d'ARNm mitochondriaux polyadénylés et un défaut d'assemblage des complexes IV et V de la chaine respiratoire. On observe également une altération de l'oxydation des acides gras à longue chaîne, une dérégulation de la perméabilité mitochondriale et une altération de la diffusion transmembranaire de H2O2. Ceci pouvant être due à un défaut d'assemblage du complexe V et/ou des modifications de la composition lipidique des membranes mitochondriales. Deuxièmement, nous avons montré que la longueur des extensions de polyA de certains ARNm mitochondriaux varie dans les tissus humains et que LRPPRC joue un rôle important dans leur stabilisation. Afin d'étudier les mécanismes physiopathologiques en jeu dans le LSFC et les partenaires fonctionnels de LRPPRC, nous avons généré des lignées cellulaires HEK293 sur-exprimant les formes sauvage ou mutées (p. A354V et p. Y172C) de LRPPRC, en fusion avec l'enzyme biotin ligase BirA. Tout d'abord, les variantes pathogènes de LRPPRC ont une demi-vie réduite et s'accumulent sous forme de foci au sein des mitochondries. Ils sont correctement localisés dans la matrice mitochondriale et forment un complexe avec SLIRP. Cependant, l'analyse de leurs partenaires en BioID montre que les variantes interagissent spécifiquement avec la protéine CLPB, une chaperonne mitochondriale AAA ATPase localisée dans l'espace inter-membranaire mitochondrial. Ces résultats suggèrent donc que des mutations faux-sens dans LRPPRC entraînent la production de protéines instables nécessitant l'activité d'une chaperonne pour les cibler correctement dans la matrice mitochondriale, expliquant les niveaux réduits de protéine LRPPRC dans les tissus des patients LSFC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,747
Score d'incertitude au seuil0,503

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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