Rnq2, A Novel Prion of Saccharomyces cerevisiae
Notice bibliographique
Résumé
Prions are amyloid‐forming, infectious proteins that have been identified in both mammals and fungi. Linked to neurodegenerative diseases in mammals, prions act as agents of epigenetic inheritance in yeast. In spite of the many studies of both yeast and mammalian prions, the mechanism allowing a non‐prion state protein to convert to the prion state remains poorly understood. Known yeast prions are similar in that they all have a relatively high asparagine (N) and glutamine (Q) content. In this study, we investigated proteins of Saccharomyces cerevisiae that contained high NQ compositions for prion characteristics. Of all the candidates investigated, one protein exhibited characteristics common to known prions. We show that a protein of unknown function, which we call Rnq2, forms aggregates in vivo and in vitro . Similarly to what has previously been observed with Rnq1, we have shown that when the prion‐determining domain of Sup35 is replaced with Rnq2, all phenotypic prion behavior of the truncated Sup35, including reversible curing with guanidine HCl, is fully restored. Our findings strongly support Rnq2 as a novel prion of S. cerevisiae . As more prions are identified and characterized, further comparisons between them can be made to define the physical characteristics, cofactors and mechanisms common to all prions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».