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Enregistrement W76034790 · doi:10.1096/fasebj.22.2_supplement.249

Rnq2, A Novel Prion of Saccharomyces cerevisiae

2008· article· en· W76034790 sur OpenAlexaff
David L. Lancaster, Melissa Dobson, Richard A. Rachubinski

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensCanBiocin (Canada)University of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFungal prionSaccharomyces cerevisiaeYeastPrion proteinAsparagineEpigeneticsBiologyBiochemistryAmyloid (mycology)MutagenesisGlutamineGeneticsPhenotypeMutantCell biologyChemistryAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prions are amyloid‐forming, infectious proteins that have been identified in both mammals and fungi. Linked to neurodegenerative diseases in mammals, prions act as agents of epigenetic inheritance in yeast. In spite of the many studies of both yeast and mammalian prions, the mechanism allowing a non‐prion state protein to convert to the prion state remains poorly understood. Known yeast prions are similar in that they all have a relatively high asparagine (N) and glutamine (Q) content. In this study, we investigated proteins of Saccharomyces cerevisiae that contained high NQ compositions for prion characteristics. Of all the candidates investigated, one protein exhibited characteristics common to known prions. We show that a protein of unknown function, which we call Rnq2, forms aggregates in vivo and in vitro . Similarly to what has previously been observed with Rnq1, we have shown that when the prion‐determining domain of Sup35 is replaced with Rnq2, all phenotypic prion behavior of the truncated Sup35, including reversible curing with guanidine HCl, is fully restored. Our findings strongly support Rnq2 as a novel prion of S. cerevisiae . As more prions are identified and characterized, further comparisons between them can be made to define the physical characteristics, cofactors and mechanisms common to all prions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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