MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W764096115 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.lb628

Recycling of The Kidney Anion Exchanger 1 Is Regulated by Adaptor Protein Complex 1B

2015· article· en· W764096115 sur OpenAlexaff
Emmanuelle Cordat, Ensaf Y. Almomani, Martin Jung, Richard Zimmermann, R. Todd Alexander

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Kidney Disease and Diabetes
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySignal transducing adaptor proteinMutantCell biologyBiochemistryPhosphorylationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adaptor protein complexes 1 (AP‐1) regulate polarized trafficking of membrane proteins. Here, we investigated the role of AP‐1B in regulating the kidney anion exchanger 1 (kAE1) intracellular trafficking. kAE1 physically interacts with AP‐1B in Madin‐Darby canine kidney cells. We hypothesized that AP‐1B regulates the recycling of endocytosed kAE1 protein and that kAE1 mutants that cause distal renal tubular acidosis, fail to properly interact with AP‐1B. We studied kAE1 WT and a dRTA mutant, kAE1 R901X, which lacks the last 11 amino acids encompassing the potential canonical binding site for AP‐1B. We confirmed the physical interaction between kAE1 and heterologously expressed μ1B subunit of AP‐1B in LLC‐PK1 renal epithelial cells lacking endogenous AP‐1B. A peptide spot assay identified multiple interaction sites of AP‐1B in the kAE1 protein sequence, including residues within the second and sixth cytosolic loops, and the C‐terminus. μ1B heterologous expression decreased the amount of plasma membrane kAE1. Although kAE1 R901X mutant underwent endocytosis slightly faster than kAE1 WT, its recycling rate was decreased compared to kAE1 WT, and was independent from μ1B expression. We also observed that (i) μ1B expression disrupts the interaction of GAPDH with kAE1 WT consistent with both proteins binding to an overlapping site on kAE1, and (ii) phosphorylation of tyrosine 904 within the carboxyl‐terminal interaction motif does not affect the kAE1/AP‐1B interaction. We propose that the apically mis‐targeted kAE1 R901X mutant fails to recycle back to the basolateral membrane due to its inability to properly interact with AP‐1B.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetChronic Kidney Disease and Diabetes→Travaux en français237 207→