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Enregistrement W86086534 · doi:10.1089/mab.2013.0058

Development of Monoclonal Antibodies to Interrogate Functional Domains and Isoforms of FREM1 Protein

2014· article· en· W86086534 sur OpenAlexafffund
Xin Yuan, Lewis Ruxi Liu, Adriana Krawchenko, James Sainsbury, Lei Zhao, Frank Plummer, Xi Yang, Ma Luo

Notice bibliographique

RevueMonoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueOcular Disorders and Treatments
Établissements canadiensUniversity of ManitobaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesPublic Health Agency of Canada
Mots-clésMonoclonal antibodyGene isoformBiologyAntibodyComputational biologyFocus (optics)VirologyImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

FREM1 was first identified as an extracellular matrix protein that is essential for the formation of the epithelial basement membrane during embryonic development. Recent studies have shown that FREM1 also modulates innate immunity through its isoform 2 splice variant protein, known as Toll-like/interleukin-1 receptor regulator (TILRR). TILRR is a co-receptor that enhances pro-inflammatory IL-1R1 signal transduction. Our previous study identified the minor allele of a SNP, rs1552896, in the intronic region of FREM1 gene to be associated with natural resistance to HIV-1 infection in a subgroup of Kenyan sex workers in the Pumwani cohort. To study the role of FREM1 and its variants in differential susceptibility to HIV-1 infection, we generated a panel of 17 monoclonal antibodies against two recombinant proteins of FREM1, rspD and rspF. Epitope mapping using overlapping pin peptides showed that the monoclonal antibody (MAb) panel interrogated seven unique regions across five different domains, including the C-type lectin domain disulfide bond and the TILRR GAG serine attachment site. Utility of three selected FREM1 MAbs were demonstrated by FACS and immunohistochemical detection of FREM1 in 293F kidney embryonic cells, HeLa 229 cervical cells, and Sup-T1 cells. Thus, these monoclonal antibodies could be used to study the functional domains of FREM1 and its isoforms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,357
Score d'incertitude au seuil0,910

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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