MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W907485562 · doi:10.1128/9781555817732.ch26

Second Chromosomes and Megaplasmids in Bacteria

2014· book-chapter· en· W907485562 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueASM Press eBooks · 2014
Typebook-chapter
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRepliconBiologyGeneGeneticsCircular bacterial chromosomeGenomeChromosomeDNA replicationBacterial genome sizeDNAOrigin of replicationPlasmid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This chapter reviews some aspects of the many major secondary DNA replicons that have been characterized from organisms that possess multireplicon genomes. Nonprimary replicons are often referred to as secondary chromosomes if they are essential for cell viability or as megaplasmids. A modern source of ambiguity in genomic biology is whether certain replicons represent megaplasmids or second chromosomes. Multircplicon genomes in bacteria could conceivably arise by a number of mechanisms, but two general mechanisms seem most plausible. A major secondary replicon may derive from an ancestral chromosome via an excision event where the excised DNA possesses an origin of replication that is either a duplicated copy of the oriC region or a second, redundant origin that was previously resident on that part of the ancestral chromosome. Chromosome I has an origin of replication typical of other bacterial chromosomes, and the region encodes the dnaA, dnaN, recF, and gyrA genes. A greater proportion of chromosome II is also devoted to genes encoding transporters and solute binding proteins and to genes encoding enzymes required in central intermediary metabolism. The linear chromosome encodes exoC and other genes required for synthesis of several cell surface polysaccharides and also the cellulose synthesis genes that are required for host attachment. Copies of genes required for the synthesis of some amino acids and for certain enzyme cofactors are carried uniquely on the megaplasmid as are the flagellar genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,955
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle