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Enregistrement W940652921 · doi:10.1161/circ.124.suppl_21.a8682

Abstract 8682: Microarray and Proteomic Analysis of Cardioprotection in the Mature and Aged Male and Female: Role of the Mitochondrion and Mitochondrial Pathways

2011· article· en· W940652921 sur OpenAlexaff
Kendra M Black, Reanne Barnett, Manoj Bhasin, Christian Daly, Simon J Dillon, Towia A. Libermann, Akihiro Masuzawa, Sidney Levitsky, James D. McCully

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensDillon Consulting
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCardioprotectionMedicineMitochondrionMicroarrayMicroarray analysis techniquesProteomicsBioinformaticsCell biologyComputational biologyInternal medicineGeneticsGeneBiologyIschemiaGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Recently we have shown that cardioprotection afforded by cardioplegia is modulated by RNA and protein dependent mechanisms and is significantly decreased with age and in particular is significantly decreased in the aged female, however, the pathways associated with these differences were unknown. Methods: Mature male and female (15 to 20 weeks; n=6 each) and aged male and female (>32 months; n=6 each) New Zealand White rabbits were used for in situ blood perfused cardiopulmonary bypass (CPB). Control hearts received 30 min sham global ischemia (GI) and 120 min sham reperfusion. GI hearts received 30 min GI, achieved by crossclamping of the aorta. Cardioplegia hearts received cold blood cardioplegia prior to GI. Following 30 min GI the crossclamp was released and the hearts were reperfused for 120 min. RNA and proteins were isolated and microarray and proteomic analysis was performed on matched samples. Results: Microarray analysis showed that cardioplegia up-regulated genes for transcription and the mitochondrion in mature male and female hearts and cytoskeleton dependent intracellular transport and cell-substrate function in aged male and female hearts. Proteomic analysis identified 362 proteins of which 132 were common to all groups. Principal component analysis indicated differential protein expression in each treatment in the mature male and female and aged male, but in the aged female there was no difference in the proteins expressed during GI and cardioplegia. Cardioplegia up-regulated glycolytic and gluconeogenic pathways in the mature and aged male and oxidative phosphorylation, the electron transport chain, propanoate and pyruvate metabolism and the induction of apoptosis in the mature and aged female. The tricarboxylic acid cycle was uniquely up-regulated by cardioplegia in the aged female but not glycolysis or gluconeogenesis. Conclusions: These data demonstrate that the mitochondrion and mitochondrial pathways play a key role in age and gender specific cardioprotection. The identification of these specific pathways will allow for the development of age and gender specific cardioprotection which should significantly decrease morbidity and mortality in the aged female undergoing open heart surgery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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