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Enregistrement W98462811 · doi:10.1385/1-59745-151-7:155

Fluorescent Reporter Methods

2006· review· en· W98462811 sur OpenAlexaff
Harald Hutter

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2006
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGreen fluorescent proteinFluorescent proteinFluorescenceCaenorhabditis elegansBiologyCell biologyProtein subcellular localization predictionAequorea victoriaFluorescence microscopeTransgeneGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The identification and cloning of the green fluorescent protein (GFP) from jellyfish marks the beginning of a new era of fluorescent reporters. In Caenorhabditis elegans, genetically encoded markers like the fluorescent proteins of the GFP family became the reporter of choice for gene expression studies and protein localization. The small size and transparency of the worm allows the visualization of in vivo dynamics, which increases the number of potential applications for fluorescent reporters tremendously. In combination with subcellular tags, GFP can be used to label subcellular structures like synapses allowing novel approaches to study developmental processes like synapse formation. Other fluorescent labels like small organic dyes, which are in widespread use in cell culture systems, are rarely used in C. elegans owing to difficulties in applying these labels through the impenetrable cuticle or eggshell of the animal. A notable exception is the use of lipophilic dyes, which are taken up by certain sensory neurons in the intact animal and can be introduced into the embryo after puncturing of the egg shell. This chapter covers the use of fluorescent dyes and fluorescent proteins in C. elegans. Emphasis is placed on microscopic techniques including wide field and confocal microscopy as well as time-lapse recordings. The use of fluorescent proteins as transgenic markers and image processing of fluorescence images are briefly discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,979
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,115
Tête enseignante GPT0,398
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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