Estrategias experimentales para el estudio de las propiedades de la proteína Core del virus de la hepatitis C
Bibliographic record
Abstract
El modelo de infeccion por el Virus de la Hepatitis C (VHC) se ha convertido en el topico de interes de numerosos equipos de investigacion, considerando el alto porcentaje de infeccion persistente asociada al VHC. En efecto, del 50 al 80% de los pacientes con infeccion por el VHC, desarrollan infeccion persistente, que puede evolucionar a cirrosis y carcinoma hepatocelular (HCC). Este modelo presenta dos obstaculos mayores para su estudio: la ausencia de un sistema eficiente de replicacion viral in vitro y el limitado numero de modelos animales. La proteina Core del VHC, ademas de ser la unidad estructural de la capside viral, parece estar implicada en las estrategias virales de persistencia y oncogenesis; nuestro grupo ha planteado estrategias experimentales para estudiar algunas de sus propiedades, tales como su capacidad inmunonoduladora en cultivos de calulas dendriticas humanas, su capacidad de modificar la expresion del ARNm en celulas HepG2 con expresion transitoria de Core y la presencia de esta proteina en tejido hepatico proveniente de pacientes con diagnostico de HCC; dichas estrategias experimentales han sido: • Produccion de la proteina Core del VHC en el sistema baculovirus y purificacion en condiciones nativas para su evaluacion en ensayos biologicos. • Expresion transitoria de la proteina Core del VHC en la linea celular HepG2, mediante transduccion con particulas recombinantes del Virus Semliki Forest (SFV). • Estudio de la expresion de p53, del estado replicativo viral y del nivel de expresion de la proteina Core del VHC, en tejido hepatico proveniente de pacientes con diagnostico de HCC asociado a la infeccion por el VHC. Aunque se logro la produccion de la proteina Core en el sistema Baculovirus, algunos inconvenientes se presentaron en la purificacion de la proteina con las tecnicas de isoelectroenfoque y electroelusion. Ensayos preliminares de la capacidad inmunomoduladora de la proteina Core obtenida en el sistema de Baculovirus, se realizaron en cultivos de celulas dendriticas obtenidas por diferenciacion de monocitos. De otra parte, se demostro la eficiencia del sistema del SFV para la expresion transitoria de altos niveles de proteina heterologa en celulas HepG2; contrario a lo observado con la proteina reportera GFP, la eficacia del sistema SFV para la expresion de la proteina Core fue menor en la linea HepG2, comparado con el resultado obtenido en BHK-21. Un analisis preliminar se realizo mediante la tecnica de DD-PCR, para la identificacion de transcritos con expresion diferencial en celulas HepG2 con expresion transitoria de Core, comparado con celulas control o con expresion transitoria de la proteina reportera, GFP. Por ultimo, la deteccion por inmunohistoquimica de la proteina Core del VHC en cortes de tejido hepatico, se logro en condiciones de pH acido con el anticuerpo monoclonal humano anti-Core B12.F8. REFERENCIAS 1. HENAO F, ALVAREZ C, RUBIO I, BALCAZAR N, NAVAS MC. Expression of heterologous protein in the human hepatoma cell line HepG2 using Semliki Forest virus expression system. ASV 22 rd Annual meeting. USA, 2003. 2. RUBIO I, HENAO F, ALVAREZ C, ARIAS A, ORTIZ B, COMBITA AL, NAVAS MC. Hepatitis C Virus Core protein production and purification in native conditions for functional assays in monocyte derived dendritric cells culture. ASV 23 rd Annual meeting. Canada, 2004.
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How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.002 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.001 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.001 | 0.001 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.001 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.001 |
| Open science | 0.001 | 0.001 |
| Research integrity | 0.001 | 0.002 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.004 | 0.001 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".