Les prényltransférases et leurs rôles biologiques chez les pucerons
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Abstract
Communication orale pour la session: Morphologie, anatomie, physiologie Les prenyltransferases et leurs roles biologiques chez les pucerons VANDERMOTEN Sophie 1 , CUSSON Michel 2 , FRANCIS Frederic 1 , HAUBRUGE Eric 1 1. Universite de Liege, Gembloux Agro-Bio Tech, Entomologie fonctionnelle et evolutive, Passage des Deportes 2, B-5030 Gembloux, Belgique. 2. Ressources Naturelles Canada, Service Canadien des Forets, Centre de Foresterie des Laurentides, 1055 rue du PEPS, P.O. Box 10380, Stn. Ste-Foy, Quebec, QC G1V4C7, Canada. Les isoprenoides (ou terpenoides) sont presents chez tous les organismes vivants et possedent des structures, des proprietes physiques et chimiques, et des activites biologiques tres diverses. Chez plusieurs ordres d’insectes, des isoprenoides sont impliques dans le developpement, dans les mecanismes de defense et/ou dans la communication chimique. La famille des prenyltransferases est impliquee dans la formation du geranyle diphosphate (GPP, C10), du farnesyle diphosphate (FPP, C15) et du geranylgeranyle diphosphate (GGPP, C20) ; lesquels sont respectivement les precurseurs universels des mono-, sesquiet diterpenes. Chez la vaste majorite des organismes vivants, ces precurseurs sont generes par des prenyltransferases distinctes: une GPP synthase (GPPS), une FPP synthase (FPPS) et une GGPP synthase (GGPPS). Chez le puceron, toutefois, nous avons recemment clone l’ADNc d’une enzyme capable de generer a la fois du GPP et du FPP. Afin d’identifier les substitutions en acides amines responsables de cette double activite GPP/FPP synthase, nous avons genere plusieurs mutants ciblant deux residus du site actif ; ces residus ayant ete choisis sur base de l’analyse comparative des modeles 3D de l’enzyme du puceron et de la FPPS aviaire. Ainsi, nous avons ete en mesure de convertir l’enzyme du puceron en des prenyltransferases generant presqu’exclusivement du GPP ou du FPP. Des analyses de dynamique moleculaire ont permis de demontrer que, contrairement aux prenyltransferases « classiques », chez lesquelles la longueur de chaine des produits formes est principalement controlee par l’encombrement sterique de certains acides amines bordant la cavite catalytique, le mecanisme de regulation chez l’enzyme du puceron semble plus complexe. Si l’encombrement sterique semble egalement jouer un role, la nature des interactions entre les principaux acides amines de la cavite catalytique et notamment la formation de liaisons hydrogene la traversant est un facteur tout aussi determinant.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.001 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.001 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.001 |
| Open science | 0.000 | 0.001 |
| Research integrity | 0.001 | 0.001 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.009 | 0.002 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".