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Record W2326744148 · doi:10.1055/s-0033-1354528

Identifizierung von „Copy Number“ Variationen in Patienten mit linksventrikulären Ausflusstraktobstruktionen (LVOTO)

2013· article· de· W2326744148 on OpenAlexaff
Marc‐Phillip Hitz, Jean‐Luc Bigras, Maryse Thibeault, Dale R. Stemple, Matthew E. Hurles, Grégor Andelfinger

Bibliographic record

VenueThe Thoracic and Cardiovascular Surgeon · 2013
Typearticle
Languagede
FieldMedicine
TopicCongenital Heart Disease Studies
Canadian institutionsCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Fundersnot available
KeywordsMolecular biologyGynecologyBiologyMedicine

Abstract

fetched live from OpenAlex

Einleitung: Ein Drittel der angeborenen Herzfehler wird durch Klappenfehlbildungen verursacht. Für viele dieser angeborenen Klappenfehler konnte bisher keine ursächliche Mutation gefunden werden. Mittels neuer genetischer Methoden war es möglich eine noch nicht beschrieben homozygote Mikrodeletion in der ADAMTS19 Metalloproteinase zu identifizieren. Methodik: Eine Patientenkohorte ( N = 462) am Sainte Justine Kinderkrankenhaus in Montreal, Quebec, Kanada wurde auf krankheitsassozierten Copy number Varianten (CNVs), die zu homozygoten Mikrodeletionen führen untersucht. Nach erfolgreicher Identifizierung und unabhängiger Validierung mittles PCR wurden weitere Kohorten und Datenbanken auf Mikrodeletionen untersucht. Die funktionelle Analyze erfolgte mittles Morpholino Gen-Knockdown in Xenopus tropicalis Oocyten. Ergebnisse: In einer Familie mit rezessivem Erbmuster entdeckten wir in den beiden Schwererkrankten eine homozygote Mikrodeletion in ADAMTS 19, einem Familienmitglied der Metalloproteinasen mit Desintegrin und Thrombospondin Motiv. Der beobachtete Phänotyp ist eine Pulmonalstenose und eine schwere Aortenklappenstenose. Zusätzlich zu der bereits beschriebenen Familie war es uns möglich zwei weitere Patienten mit einem hypoplastischne Linksherzsyndrom und einer Duplikation am ADAMTS19 Locus zu identifizieren. Morpholinoinjektionen in Xenopus tropicalis Oocyten unterstützten eine Rolle während der Entwicklung des embryonalen Herzens. Schlussfolgerungen: Eine detaillierte Analyze der von uns identifizierten genetischen Varianten in dieser Familie, sowie den beiden Patienten mit HLHS ermöglicht ein besseres Verständnis der zugrundeliegenden Erkrankungsmechanismen inklusive der Bedeutung der extrazellulären Matrix-Gene während der Herzklappenentwicklung.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: Observational
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.002
Threshold uncertainty score0.008

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.003
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.012
GPT teacher head0.254
Teacher spread0.242 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2013
Admission routes1
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