Caractérisation des protéines Str3 et Tpx1 dans l’homéostasie de l’hème chez la levure Schizosaccharomyces pombe.
Bibliographic record
Abstract
La molécule d’hème est un groupement prosthétique qui est requis par de nombreuses \nprotéines impliquées dans des processus cellulaires vitaux. En excès, la molécule d’hème \nlibre est toxique car elle peut facilement causer des dommages aux membranes ou participer \nà la formation d’espèces réactives à l’oxygène. Son homéostasie doit donc être \nrigoureusement régulée. Pour obtenir l’hème de façon exogène, les organismes ont développé \nune panoplie de stratégies afin de l’acquérir. De plus, pour plusieurs organismes incluant les \nlevures pathogènes, il a été montré que leur capacité à acquérir l’hème est souvent en lien \ndirect avec leur habilité à infecter l’hôte. Chez l’organisme modèle, Schizosaccharomyces \npombe, il a été découvert que la protéine de surface Shu1 est impliquée dans l’acquisition \nd’hème. Une souche délétée pour le gène hem1+ n'est plus capable de synthétiser de l’hème. \nElle doit donc recourir à l'acquisition d’hème exogène pour survivre. Une souche \nhem1Δ shu1Δ n'est pas capable de croître en présence d'une faible quantité d’hème \n(0,075μM) dans le milieu de culture. Nous avons montré dans cette thèse que si cette \nconcentration excède 0,15μM, la souche est capable de croître, suggérant l'existence d'un \ndeuxième transporteur d’hème. Cette croissance est dépendante de la protéine Str3 qui code \npour un transporteur de type MFS (Major Facilitator Superfamily transporter). Ainsi, une \nsouche hem1Δ shu1Δ str3Δ présente une incapacité de croître en présence de 0,15μM \nd’hème, montrant l'importance de str3+ à cette concentration d’hème. La protéine Str3 se \nlocalise à la surface cellulaire. Elle a la capacité de lier de l’hème via une boucle \nextracellulaire. Enfin, la présence de Str3 à la surface cellulaire permet l’entrée dans la cellule \nde Zinc-Mésoporphyrine (ZnMP), un analogue fluorescent de l’hème. Nous avons ensuite \nmontré que Str3 interagit avec la peroxyrédoxine Tpx1 en présence d’hème. La protéine \nTpx1, initialement caractérisée pour sa réponse au stress oxydatif, est capable de lier deux \nmolécules d’hème au niveau de deux motifs CP. La mutation des deux motifs CP abolie la \ncapacité de croissance en présence de 0.15μM d’hème d’une souche délétée pour les gènes \nhem1+ et shu1+ (hem1Δ shu1Δ). Ainsi, Tpx1 et Str3 participent à une voie commune \nd’assimilation de l’hème chez S. pombe. Enfin, nos résultats montrent que la présence de Str3 \net Tpx1 est requise pour le fonctionnement de l’hémoprotéine Frp1, une ferriréductase de \nsurface.
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How this classification was reachedexpand
Full frame distilled prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.
Codex and Gemma teacher scores by category
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.005 |
| Scholarly communication | 0.000 | 0.000 |
| Open science | 0.001 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.000 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one teacher head, not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".