Iron acquisition and haemolysin production by strains of the Actinobacillus minor/"porcitonsillarum" complex
Bibliographic record
Abstract
Six membres du complexe d'Actinobacillus minor/"porcitonsillarum", souches 33PN et 7ATS, souches NM305T et 202 d'Actinobacillus minor, et souches 0347 et 9953L55 d'Actinobacillus 'porcitonsillarum', ont été étudiés en ce qui concerne l'acquisition du fer et la production d'hémolysine. Traditionnellement, l'activité hémolytique a été employée afin de distinguer entre A. minor et 'A. porcitonsillarum', le dernier organisme étant hémolytique tandis que le premier étant non hémolytique. Cependant, l'analyse génomique des séquences entières de shotgun ont indiqués que la souche A. minor 202, tel que 'A. porcitonsillarum', possède un opéron d'apxII qui code pour l'hémolysine alors que la souche NM305T n'en possède pas. Les approches de PCR ont permis l'amplification des gènes d'apxII de la souche 33PN, mais pas de la souche 7ATS, suggérant que la souche 33PN, mais pas 7ATS, possède également un opéron d'apxII. Tous les six souches ont produit des hémolysines qui pourraient lyser des érythrocytes provenant du lapin. Les spécificités d'érythrocyte des hémolysines produites par les espèces 202 et 33PN ont indiqué que les activités hémolytiques de ces souches étaient dues à ApxII. L'analyse de la séquence d'acides aminés de la souche de Apxll 202, en utilisant les outils de bioinformatique MitoProt II, a révélé que la région N-terminale de cette protéine a le potentiel pour servir de signal d'adressage mitochondrial.En accord avec la possibilité d'un manquement de gènes d'apxII chez les souches NM305T et 7ATS, les hémolysines produites par ces organismes n'étaient pas spécifiques à l'érythrocyte et l'activité hémolytique semblait être due par une combinaison des composants labiles à la chaleur et thermostables.Tous les six souches avaient acquis le fer provenant de l'hémoglobines porcines, bovines et humaines mais pas de la transferrine porcine. Les analyses génomiques des séquences entières de shotgun ont démontré que les souches NM305T et 202 manquaient non seulement des gènes codant pour des protéines pouvant lier la transferrine, en particulier le tbpA et du tbpB, mais également le gène hgbA qui code pour le protéine pouvant lier des hémoglobines. Cependant, les souches NM305T et 202 se sont avérées de posséder d'autres gènes putatif codant pour des protéines pouvant lier le haemin/hémoglobine qui ont été prévus de coder pour des protéines matures de ~72 et ~75 kDa, respectivement. Une procédure d'affinité basée sur l'agarose de haemin a permis l'isolement des polypeptides répressif du fer provenant de la membrane externe des souches de NM305T and 202, respectivement, et ayant une masse entre ~65 et ~67-kDa, tandis que la spectrométrie de masse a démontré que ces polypeptides étaient les produits des gènes putatif codant pour des protéines pouvant lier le haemin/hémoglobine. Les approches de PCR ont permis l'amplification et le séquencement des homologues de gènes codant pour les protéines pouvant lier le haemin/hémoglobine de chacune des quatre autres souches, notamment les souches 33PN et 7ATS, et souches 9953L55 et 0347 d'A. "porcitonsillarum", suggérant que de telles protéines sont impliquées dans l'utilisation du fer lier a l'hémoglobine, vraisemblablement en tant que des récepteurs trouvant sur la surface, par chacune des six souches étudiées.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.000 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.001 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".