Bibliographic record
Abstract
L’homéostasie cellulaire est la capacité d’une cellule à maintenir son équilibre et sa fonctionnalité. Une des causes de l’instabilité de cet équilibre est le stress. En effet, le stress provoque une accumulation des protéines mal repliées, qui peuvent former des agrégats provoquant des maladies neurodégénératives. Les protéines « chaperons » sont le principal mécanisme du repliement des protéines et du contrôle de leur qualité. Celles-ci forment le cœur d’un réseau qu’on appelle le réseau d’homéostasie des protéines. Celui-ci a pour but de contrôler, d’assurer et de protéger le protéome , par le biais de la réparation du repliement et l’élimination des agrégats. Le réseau joue un rôle essentiel pour garder l’homéostasie protéique cellulaire dite protéostasie. Actuellement, nous manquons de connaissances fondamentales sur la façon dont ce réseau fonctionne en équilibre, mais aussi comment il échoue lors d’un déséquilibre. Par exemple, le rat-taupe nu, Heterocephalus glaber, a un cycle de vie lent qui peut dépasser 30 ans. Il a un mécanisme résistant au stress et un bon système du réseau, ce qui lui permet d’atteindre facilement un équilibre au niveau de son fonctionnement cellulaire. À l’inverse, le poisson, Nothobranchius furzeri, dont l’espérance de vie est très courte présente un processus de vieillissement accéléré et une perturbation de l’homéostasie. Il est à propos de se demander, comment cet équilibre fonctionne-t-il chez ces organismes et chez d’autres ? Ce projet de recherche utilise des approches bio-informatiques et de génomique comparative, afin de mettre en évidence les principes fondamentaux de la protéostasie. L’évolution du réseau des chaperons sera analysé dans le contexte de l’adaptation du protéome. En reliant à l’échelle évolutive, nous analyserons la diversification du réseau des chaperons à travers la phylogénie et l’unirons à l'évolution du protéome. Ce projet de maîtrise apporte des notions fondamentales sur l'évolution du réseau de l'homéostasie des protéines. Précisément, nous présentons une analyse comparative des chaperons de 216 espèces eucaryotiques qui indiquent que l’équilibre de la protéostasie peut être une élément clé pour expliquer la robustesse de l’organisme.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.001 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.001 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.001 | 0.001 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.001 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.002 |
| Scholarly communication | 0.003 | 0.002 |
| Open science | 0.001 | 0.001 |
| Research integrity | 0.001 | 0.002 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.003 | 0.002 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".