The gut microbiota's temporal dynamics and relationships with individual traits in a wild eastern chipmunk population
Bibliographic record
Abstract
Le microbiote intestinal varie selon les espèces hôtes, les individus et au cours du temps. Selon des études récentes, les communautés de microorganismes intestinaux peuvent avoir un impact important sur diverses fonctions de l'hôte, telles que le développement, l'immunité, la physiologie et le comportement. Dans la nature, les variations du microbiote intestinal entre les individus conduisent à des différences d’aptitude. De plus, des études récentes sur des souris et des rats de laboratoire ont révélé des relations entre les comportements liés à l'anxiété et la diversité et la composition du microbiote intestinal. Cependant, les études dans des contextes naturels sont rares, de sorte que les facteurs influençant la variation du microbiote dans les populations naturelles demeurent flous. L'objectif général de ce mémoire est d'étudier la variation individuelle du microbiote intestinal dans des conditions naturelles. Plus précisément, j'examine les dynamiques temporelles des microbes intestinaux et j’explore les liens entre le microbiote et les caractéristiques de l'hôte, avec un accent particulier sur le comportement. Nous avons suivi une population naturelle de tamias rayés (Tamias striatus) dans le sud du Québec en 2021 et 2022, et recueilli des échantillons fécaux pour estimer la composition bactérienne. Nous avons utilisé une approche de modèle mixte, des analyses de répétabilité et une partition de la variance des communautés microbiennes pour examiner les dynamiques du microbiote intestinal en utilisant plusieurs mesures de diversité. Nous avons montré que l'âge des tamias était un prédicteur significatif de la diversité-α du microbiote, et que la composition bactérienne intestinale variait en fonction du comportement et du site de capture. De plus, nous avons constaté que la diversité du microbiote était stable et hautement individualisée au sein d'une saison d’activité, mais que ces différences entre individus ne persistaient pas d'une année à l'autre. Nos résultats soutiennent la relation entre le microbiote intestinal et le comportement de l'hôte chez les mammifères et renforcent l'évidence croissante que l'individualité de la diversité et de la composition bactérienne dépend du temps. _____________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : microbiome intestinal, écologie comportementale, variation individuelle, stabilité, répétabilité
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.000 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.001 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".