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Record W7019162932

Evolutionary potential of a large marine vertebrate, the lemon shark («Negaprion brevirostris»)

2009· dissertation· en· W7019162932 on OpenAlexfundno aff

Bibliographic record

VenueeScholarship@McGill (McGill) · 2009
Typedissertation
Languageen
FieldEnvironmental Science
TopicIchthyology and Marine Biology
Canadian institutionsnot available
FundersNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFlorida Sea Grant, University of FloridaUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignMcGill UniversityCompany of BiologistsNational Geographic SocietyNational Fish and Wildlife FoundationUniversity of MiamiNational Science Foundation
KeywordsMatingAdaptation (eye)Natural selectionSelection (genetic algorithm)Local adaptationMating systemGenetic divergence
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

Afin de prédire comment les animaux vont réagir aux futurs changements environnementaux, il est important de comprendre les processus évolutionnaires qui dictent la biodiversité de la nature.Par contre, peu ont pu surmonter les contraintes logistiques qui accompagnent de telles études sur le terrain.Les gros vertébrés marins sont particulièrement difficiles en raison de leur nature énigmatique et très ambulatoire.Ceci mène certains chercheurs à croire que l'adaptation locale sera très rare.Cependant, il y a une augmentation de cas ou les organismes marins, avec un haut potentiel de se propager, divergent de façon phénotypique sur des petites échelles spatiales.Dans cette thèse, j'utilise des méthodes génétiques quantitatives afin de supporter l'hypothèse de l'adaptation locale d'un gros vertébré marin, le requin citron (Negaprion brevirostris).Mon étude exploite les échantillons obtenus depuis 1995 d'une pouponnière de requins citron située dans une lagune isolée (Bimini, Bahamas), ainsi que des données récoltées de façon opportune à un autre site dans les Florida Keys (Marquesas Key).Ce system d'étude est particulièrement intéressant à cause des différences de taille des juvéniles ainsi que des taux de croissance entre les sites.Je débute cette thèse en utilisant des marqueurs microsatellitaires, afin de reconstruire le pedigree des populations.Ceci me permet de caractériser le système d'accouplement des requins citron à la lumière des différences des antécédents de leur jeune vie.Les patrons du système d'accouplement étaient consistants entre les sites -les femelles adultes ont démontré une fidélité élevée à chaque pouponnière pour la parturition et elles se sont accouplés avec plusieurs v males (i.e., polyandre).Nous ne pouvons pas expliquer la polyandre que nous avons observé par des bénéfices directs ou indirects.Alors je suggère que les femelles s'accouplent avec plusieurs males afin d'éviter d'être harceler par ceuxci.Par la suite, j'ai estimé la sélection et l'héritabilité associé avec les traits morphologiques des requins à Bimini, et j'ai découvert que les petits individus à croissance lente était favori, et que certains traits étaient héritables.Ces découvertes supportent un scénario d'adaptation local contraint, par lequel les juvéniles sont partiellement adaptés à leur pouponnière respective.Par contre, des pressions divergentes agissent à d'autres stages de leur vie et, avec la dispersion des males, il est probable que cela maintien une sélection forte et une haute héritabilité.En résumé, ma thèse démontre que la génétique quantitative peut être utilisée afin de comprendre le processus d'évolution qui influence la diversité biologique dans les gros vertébrés marins.A l'avenir, la recherche pourra bénéficier en prenant en considération la relation entre l'adaptation locale et la transmission de gène dans les organismes marins ambulatoire.vi

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: Observational
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.003
Threshold uncertainty score0.009

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0010.000
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.001
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0030.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.006
GPT teacher head0.215
Teacher spread0.210 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Citations0
Published2009
Admission routes1
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