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Record W7070980320

Rôle de la protéine tyrosine phosphatase DEP-1 dans la régulation du programme
\nangiogénique induit par le VEGF

2010· other· fr· W7070980320 on OpenAlexfundno aff

Bibliographic record

VenuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2010
Typeother
Languagefr
FieldMaterials Science
TopicClay minerals and soil interactions
Canadian institutionsnot available
FundersInstitut Du Cancer de MontréalUniversité de MontréalCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
KeywordsProtein tyrosine phosphataseTyrosine phosphorylationVEGF receptorsTyrosine kinaseVascular endothelial growth factor
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

Depuis la découverte de la première protéine possédant une activité tyrosine \nkinase (protein tyrosine kinase [PTK]) dans les années 1980, l’importance des PTKs et \nde la phosphorylation sur résidu tyrosine dans la régulation des événements de \nsignalisation intracellulaire est bien établie. Quant aux protéines qui possèdent une \nactivité tyrosine phosphatase (protein tyrosine phosphatase [PTP]), dont l’existence n’a \nété dévoilée qu’une dixaine d’années plus tard, elles ont longtemps été perçues comme \ndes enzymes dont le rôle ne se résumait qu'à contrecarrer passivement les activités des \nPTKs. Il est maintenant clair que les activités des PTPs sont spécifiques, hautement \nrégulées, et qu’elles doivent être coordonnées avec celles des PTKs pour une régulation \nadéquate des événements de signalisation intracellulaire. En dépit de cette évidence, la \ncontribution des PTPs à la régulation des différents processus physiologiques \nfondamentaux demeure encore peu caractérisée. C’est le cas, notamment, de \nl’angiogenèse, le processus par lequel de nouveaux vaisseaux sanguins sont formés à \npartir de ceux préexistants. Le VEGF (Vascular endothelial growth factor), un des \nfacteurs angiogéniques les plus importants, est connu pour induire majoritairement ses \neffets biologiques via l’activation du récepteur à activité tyrosine kinase VEGFR2 \n(Vascular endothelial growth factor receptor 2). Puisque l’angiogenèse est impliquée \ndans le développement d’une multitude de pathologies, dont la progression tumorale, \nune meilleure caractérisation des PTPs qui assurent la qualité de la réponse \nangiogénique en agissant de pair avec le VEGFR2 s’avère cruciale et ce, afin de raffiner \nles outils thérapeutiques actuels. \nL’expression de la PTP DEP-1 corrèle avec la déphosphorylation du récepteur \nVEGFR2 localisé au niveau des jonctions cellules-cellules et contribue à l’inhibition de \nla prolifération des cellules endothéliales en réponse au VEGF lorsque les cellules sont \nà confluence. Par contre, la contribution spécifique de DEP-1 à la régulation des voies \nde signalisation et des réponses biologiques induites par le VEGF demeurait toujours \ninconnue. Les travaux de recherche présentés dans cette thèse démontrent tout d’abord \nque DEP-1 régule négativement l’activité tyrosine kinase de VEGFR2 en \ndéphosphorylant spécifiquement les résidus tyrosine Y1054/Y1059 de sa boucle \nd’activation. Cette déphosphorylation mène par conséquent à une diminution générale \nde la phosphorylation du récepteur et à une atténuation de la plupart des voies de \nsignalisation induites par le VEGF, incluant la voie mitogénique PLCγ-ERK1/2. Par \nailleurs, malgré ce rôle négatif global, nos travaux révèlent étonnement, et pour la \npremière fois, que DEP-1 contribue d’une manière positive à la promotion de la survie \ndes cellules endothéliales via l’activation de la voie Src-Gab1-Akt en aval du récepteur \nVEGFR2. Ce pouvoir pro-survie de DEP-1 dans les cellules endothéliales réside avant \ntout dans sa capactié à déphosphoryler la tyrosine inhibitrice de Src (Y529). Au cours \nde notre étude, nous avons pu identifier deux résidus tyrosine au niveau de l’extrémité \ncarboxy-terminale de DEP-1, Y1311 et Y1320, dont la phosphorylation est dépendante \nde Src. Nos travaux révèlent par ailleurs que ces deux résidus tyrosine phosphorylés \nlient le domaine SH2 de Src et que la Y1320 est principalement requise pour \nl’activation de Src et d’Akt en réponse au VEGF dans les cellules endothéliales. \nCes résultats constituent donc une avancée majeure dans la compréhension des \nmécanismes moléculaires par lesquels DEP-1 peut réguler le programme angiogénique \ndépendant du VEGF. De plus, cette découverte d’un rôle positif pour DEP-1 dans la \nsurvie des cellules endothéliales pourrait mener à l’élaboration de nouvelles approches \nthérapeutiques visant à inhiber cette fonction spécifique de DEP-1 pour bloquer l'angiogenèse pathologique.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.004
Threshold uncertainty score0.007

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0010.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.006
GPT teacher head0.183
Teacher spread0.177 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Citations0
Published2010
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