Advancing mosquito surveillance in the Arctic for population monitoring and virus detection
Bibliographic record
Abstract
Le réchauffement planétaire qui impacte l'Arctique affaiblit la barrière climatique et favorise la propagation de virus transmis par les moustiques, constituant une menace pour la santé humaine. Dans ces régions nordiques, les virus les plus susceptibles d'émerger ou de réapparaître sont ceux du sérogroupe californien (CSGV), en particulier le virus Jamestown Canyon (JCV) et le virus Snowshoe Hare (SSHV). Ces virus sont transmis à l'homme par des moustiques infectés du genre Aedes Meigen, 1818 dits « à pattes noires », difficiles à différencier en raison de leur morphologie similaire. En raison de l'absence de travaux récents sur les moustiques dans l'Arctique de l’Amérique du Nord au cours des quarante dernières années, la distribution et le rôle de vecteur des moustiques restent mal connus, ainsi que la gamme de virus qu'ils peuvent potentiellement transmettre. Cette thèse vise à répondre à la question de recherche suivante : Quelles approches permettent d’améliorer les connaissances sur les populations de moustiques et la circulation des virus du sérogroupe californien dans l’Arctique de l’Amérique du Nord, afin de mieux comprendre la dynamique des arbovirus émergents dans cette région ? Dans un contexte de surveillance des moustiques dans l'Arctique de l’Amérique du Nord, trois objectifs clés se dégagent : 1) Développer un protocole d'échantillonnage efficace et adapté aux régions arctiques isolées; 2) Évaluer la performance du codage à barres ADN, plus précisément le Cytochrome C Oxidase Subunit I (COI) et l’Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2), pour identifier les espèces de moustiques les plus fréquentes et morphologiquement similaires; 3) Mettre en place un programme de surveillance des moustiques axé sur les CSGV à l'échelle de l'Arctique. Pour le premier objectif, nous avons collecté des moustiques dans sept régions nordiques à l’aide d’un filet à papillon. Cette méthode d'échantillonnage s’avère être efficace pour la capture de moustique dans les communautés inuites et les stations de recherche en milieu éloigné. Pour le deuxième objectif, nous avons d'abord analysé morphologiquement quatre espèces de moustiques arctiques étroitement apparentées à l'aide de clés dichotomiques : Aedes punctor (Kirby, 1837) et Aedes hexodontus Dyar, 1916, Aedes impiger (Walker, 1848) et Aedes nigripes (Zetterstedt, 1838). Par la suite, nous avons exploré la performance de l'utilisation du codage à barres de l'ADN (COI et ITS2) pour identifier ces espèces. Nos résultats démontrent qu'il est pratiquement impossible de différencier morphologiquement Ae. punctor et Ae. hexodontus dans leur distribution nordique de la forêt boréale (i.e., taïga). De plus, certains spécimens collectés à Kuujjuaq, dans le nord du Québec, présentent un mélange des traits morphologiques associés à ces deux espèces. Pour ce qui est de la performance des codes-barres d’ADN, le COI et l’ITS2 ne peuvent pas différencier Ae. punctor et Ae. hexodontus, alors que seul le code-barres COI permet de différencier Ae. impiger et Ae. nigripes. Pour le troisième objectif, nous avons mis en œuvre un programme de surveillance des moustiques sur trois ans, couvrant neuf régions différentes de l'Arctique de l’Amérique du Nord afin de détecter les CSGV. En tout, nous avons capturé 4084 moustiques et identifié 19 espèces distinctes. Nos résultats démontrent la présence du JCV dans dix espèces de moustiques sur sept sites distincts, tandis que le SSHV n'a été trouvé que dans une seule espèce sur un seul site. En outre, nos résultats incluent la toute première détection du JCV en Amérique du Nord chez Ae. impiger, Aedes pionips Dyar, 1919 et Aedes euedes Howard, Dyar, & Knab, 1913, ainsi que la première mention du JCV au Groenland. Cette thèse apporte une contribution significative en fournissant de nouvelles informations sur les populations de moustiques de l'Arctique de l’Amérique du Nord et sur la présence du JCV et du SSHV dans cette région. Nos résultats fournissent des données actualisées sur la liste de présence de plusieurs espèces de moustiques arctiques. De plus, nous avons contribué au débat en cours sur le statut taxonomique d'Ae. punctor et d'Ae. hexodontus dans la partie septentrionale de leur aire de répartition tout en reconnaissant la nécessité de poursuivre les recherches sur leur rôle de vecteur et sur leur cycle de développement de ces deux espèces, nous proposons de les regrouper sous le nom d'Aedes punctor-hexodontus. Nos résultats sur la distribution des moustiques serviront de point de référence important pour surveiller les changements de population de moustiques arctiques à l'avenir. Dans l'ensemble, cette thèse a permis de mettre à jour nos connaissances sur la distribution des espèces de moustiques et la présence du CSGV dans l'Arctique de l’Amérique du Nord, tout en formulant des recommandations pour les futurs programmes de surveillance.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.006 | 0.004 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.001 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.001 | 0.001 |
| Bibliometrics | 0.003 | 0.002 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.003 | 0.002 |
| Open science | 0.001 | 0.002 |
| Research integrity | 0.001 | 0.001 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.003 | 0.002 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".