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Record W7104466391 · doi:10.71781/11182

α- Amino-δ-lactame azapeptide

2023· dissertation· en· W7104466391 on OpenAlexfundno aff

Bibliographic record

VenueOpen MIND · 2023
Typedissertation
Languageen
FieldMaterials Science
TopicSupramolecular Self-Assembly in Materials
Canadian institutionsnot available
FundersUniversité de Montréal
KeywordsSemicarbazidePeptide fragmentChemical solution

Abstract

fetched live from OpenAlex

La maladie d'Alzheimer (AD) est le type le plus courant de démence, qui se classe au septième rang des causes de décès. Elle se caractérise par l'accumulation de dépôts anormaux de protéines, avec des plaques amyloïdes et des enchevêtrements neurofibrillaires de tau. Les cyclopeptides D, L-α-peptides peuvent imiter les caractéristiques structurales et biochimiques des protéines amyloïdes. Ces peptides cycliques reproduisent des feuillets β croisés en formant des nanotubes grâce à des interactions de liaisons hydrogène. À titre d'exemple, le CP-2 a montré une activité anti-amyloïdogène en réagissant avec des protéines amyloïdogènes. Le CP-2 perturbe et élimine les oligomères amyloïdes en passant dynamiquement entre des états auto-agrégés et dissociatifs. L'utilisation d'un semicarbazide en tant que résidu d'aza-glycine dans un analogue du CP-2, fournit un donneur d'hydrogène supplémentaire pour moduler l'assemblage des nanotubes et interagir avec l'amyloïde menant à l'inhibition de l'agrégation de l'Aβ. Compte tenu de l'importance de la géométrie en tour β pour faciliter le repliement de l'Aβ en agrégats, l'incorporation de résidus d'α-amino-δ-lactame (Adl) devrait augmenter la rigidité de la structure du CP-2 par rapport au peptide d'origine. De plus, la partie semicarbazide du résidu Adl-azaGly devrait renforcer la capacité de liaison hydrogène avec l'Aβ. Ces modifications structurales ont le potentiel d'influencer les caractéristiques anti-amyloïdogènes du CP-2 et son efficacité contre la toxicité de l'Aβ. De plus, la N-alkylation des résidus d'aza-Gly dans les Adl-azaGly peptides CP-2 a été utilisée pour incorporer les chaînes latérales sur l'azote du résidu d'aza, élargissant ainsi les bibliothèques de composés des analogues du CP-2. Cette N-alkylation peut influencer l'auto-assemblage du peptide CP-2, son interaction avec l'Aβ, les propriétés anti-amyloïdogènes et l’activité contre la toxicité de l'Aβ. De tells modifications structurales ont le potential d’influencer les propriétés anti-amyloïdogènes du CP-2 et son activité contre la toxicité de l'Aβ, qui sont actuellement évaluées dans le labratoire Rahimpour.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.004
Threshold uncertainty score0.015

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0040.002

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.040
GPT teacher head0.344
Teacher spread0.304 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2023
Admission routes1
Has abstractyes

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Same venueOpen MINDSame topicSupramolecular Self-Assembly in MaterialsFrench-language works237,207