Evaluating the environmental impact of vertebrate body decomposition : a soil biogeochemical perspective
Bibliographic record
Abstract
La matière organique du sol (MOS) est un important réservoir d'énergie et de nutriments dans les environnements terrestres. L'équilibre entre les apports, la transformation et le recyclage de la MOS est essentiel pour maintenir la santé des écosystèmes. Le parcours de la MOS dans l’écosystème est contrôlé par des interactions réciproques entre sa chimie et les communautés bactériennes. Ces dynamiques sont bien documentées pour la MOS issu de la matière végétale, mais celles provenant des vertébrés restent peu étudiées. Outre un apport concentré de la MOS, la décomposition des vertébrés libère aussi des bactéries entériques et des substances inorganiques (ex. sels, minéraux), produisant une zone de sol biochimiquement perturbée appelée l’îlot de décomposition cadavérique (IDC). L’augmentation de la mortalité animale due au changement climatique et l’essor de la recherche médico-légale sur la décomposition ont suscité des inquiétudes vers l’impact environnemental de la décomposition des vertébrés. Cette thèse explore ces enjeux en étudiant l'interaction entre la chimie de la MOS et les bactéries au sein des IDCs, en évaluant : (1) la quantité et les caractéristiques chimiques de la MOS et de ses fractions solubles, (2) l'activité, le métabolisme et la structure des communautés bactériennes, (3) les liens entre la chimie de la MOS et les réponses bactériennes, et (4) la manière dont ces dynamiques diffèrent selon les conditions saisonnières et régionales. Trois études ont été menées sur des IDCs (porcs ou humains) dans une forêt tempérée (Québec, Canada) puis dans une savane tropicale (Hawaï, États-Unis). Au cours de ces études, les effets des IDCs se limitaient aux sols peu profonds (<14 cm) dans un rayon d’échantillonnage de 20 cm autour des restes. Les analyses chimiques ont révélé des apports accrus de composés labiles issus surtout des tissus et sous-produits microbiens. Ceux-ci ont été associés à une augmentation de la respiration bactérienne et du métabolisme des glucides et acides carboxyliques. La croissance bactérienne a toutefois été inhibée, suggérant une allocation de la MOS vers la respiration plutôt que la biomasse. De plus, les apports labiles étaient corrélés à l’émergence de bacilles, de clostridies et de gammaprotéobactéries, néanmoins chacun de ces taxons contribuant différemment aux changements d’activité et de fonction de la communauté. Les pics de matière labile et de réponses bactériennes ont diminué avec le temps, mais le traitement microbien de la MOS a entraîné la formation de composés humiques persistants (>1 an). Les apports et les transformations microbiennes de la MOS se sont étonnamment poursuivis dans des conditions froides, mais à un rythme et ampleur réduite. De plus, la décomposition dans différentes régions géographiques a mené à des changements similaires dans la chimie de la MOS, néanmoins les bactéries des sols tropicaux semblaient plus sensibles aux apports labiles. Ces résultats mettent en évidence le rôle des apports de MOS dans les IDC, agissant à la fois comme une ressource et une perturbation écologique. Cela permettra d'élaborer des stratégies de gestion environnementale ainsi qu’a contribué à une meilleure intégration des apports vertébrés dans des cycles biogéochimiques.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.001 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.001 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.001 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.001 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".