Effects of nitrogen fertilizer and canola growth stage on the community structure and abundance of soil ammonia oxidizers
Bibliographic record
Abstract
L'usage des fertilisants à base d'azote est une pratique répandue. Ces fertilisants sont appliqués dans le but d'améliorer la croissance et la productivité des plantes. Fréquemment, ces fertilisants sont appliqués sous la forme d'urée ou de nitrate d'ammonium. Les archées (AOA) et bactéries (BOA) oxydantes d'ammoniaque sont des microbes omniprésents dans les sols qui sont capables de métaboliser ces sources d'azote par l'action de l'enzyme monooxygénase d'ammoniac (MOA). Les produits de cette réaction métabolique sont des nitrites qui sont eux-mêmes transformés en nitrates par l'action de l'enzyme oxidoréductase d'hydroxylamine (OHA). Les nitrites et les nitrates sont des ions avec charges négatives qui peuvent donc être facilement enlevés de la matrice du sol par l'action d'une variété de procédés physiques, chimiques et biologiques. En plus de réduire la quantité d'azote disponible aux plantes, ce qui peut avoir comme conséquence une réduction de leur, la perte d'azote peut engendrer des pertes économiques et des impacts néfastes sur l'environnement et sur la santé humaine et animale. Les AOA et les BOA pourraient aussi entrer en compétition avec les plantes cultivées au niveau de l'ammoniaque disponible dans le sol, ce qui pourrait aggraver la situation. L'objectif du travail présenté ici était de découvrir les effets de quelques niveaux de fertilisants à base d'urée (0, 50, 100 et 150 kg·N/ha) sur l'abondance et la composition de la communauté de AOA et de BOA dans une plantation de canola (Brassica napus) située à Ottawa, au Canada. De plus, le sol a été échantillonné à trois étapes de croissance de la plante (formation des rosettes, fleuraison et formation de cosses) dans le but d'étudier les effets des étapes de croissances des plantes sur les AOA et BOA. L'abondance et la structure des communautés d'AOA et BOA ont été évaluées en utilisant respectivement des méthodes de PCR quantitatif (qPCR) et de pyroséquençage 454. Le niveau de fertilisant avait un effet significatif (p<0.05) sur l'abondance de BOA, mais pas sur celui de AOA. L'effet des stades de croissance des plantes n'était pas significatif pour les AOA, ni pour les BOA, alors que le facteur d'interaction entre le niveau de fertilisant et le stade de croissance des plantes était significatif pour les deux groupes. La structure de la communauté et les diversités α et β n'ont pas été affectés par les traitements de fertilisants en ce qui concerne les AOA. Deux unités opérationnelles taxonomiques (OTU) des BOA (Nitrosospira multiformis and Nitrosomonadacaea other) ont été affectées de manière significative par le niveau de fertilisant. Toutefois, il n'y avait aucun effet des stades de croissance des plantes sur la communauté des BOA.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.001 | 0.001 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.002 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".