Characterization of sulfer metabolizing microbes in a cold saline microbial mat of the Canadian High Artic
Bibliographic record
Abstract
Le système de source de Gypsum Hill (GH) est situé sur l'île d'Axel Heiberg dans le Haut-Arctique, et évacue perpétuellement de l'eau hypersaline, froide et riche en composés soufrés. Les tapis microbiens se trouvent à côté des canaux de source GH. Cette thèse est la première analyse détaillée des tapis microbiens de source Gypsum Hill et leur diversité microbienne. Des analyses physico-chimiques de l'eau saturant le tapis microbiens de source GH montrent que durant l'été il est froid (9 ° C), hypersalin (5,6%), et contient du sulfure (0-10 ppm) et du thiosulfate (> 50 ppm). Des analyses en pyroséquençage ont été effectuées sur les transcriptions ARNr 16S (c.-à-ADNc) et sur des gènes (c.-à-ADN) pour enquêter sur la composition des communautés du tapis, de sa diversité, et des membres présumés actifs. Afin d'étudier la communauté réductrice de sulfate en détail, le gène de la réductase sulfite et sa transcription ont également été séquencés. Enfin, des cultures d'enrichissement pour les bactéries réductrices de soufre/sulfate ont été mises en place et suivies pour la production de sulfure à des températures froides. Dans l'ensemble, le métabolisme du soufre s'est trouvé être un élément important du système de tapis microbien GH, en particulier la fraction active, étant donne que 49% de l'ADN et de 77% de l'ADNc de banques bactériennes de gènes ARNr 16S ont été classés comme étant un taxon capable de la réduction ou l'oxydation des composés de soufre. Les principaux éléments des banques bactériennes sont Gamma-, Epsilon, et Deltaproteobacteria, Flavobacteriia et Actinobacteria. La communauté de tapis microbien GH semble être fortement influencée par les micro-organismes présents en amont de sédiments des sources GH. Des enquêtes fermées d'espèces d'archées et des bactéries réductrices de sulfate dans le tapis microbien ont révélé la présence d'embranchements énigmatique pour laquelle aucun représentant n'a encore été isolé. En plus de bactéries sulfato-réductrices, une variété de bactéries réductrices de soufre élémentaire ont été détectés à partir du tapis microbien GH, y compris Desulfuromusa, Desulfuromonas, et Sulfurospirillum. Aussi, des cultures enrichies avec soit du soufre élémentaire, thiosulfate, ou du sulfate, et inoculé avec les sédiments provenant des sédiments des sources sulfurées d'Axel Heiberg montrent généralement du sulfure à basse température (5 ° C et 10 ° C), ce qui indique que de nombreux différents composés soufrés peuvent être métabolisés à l'intérieur des ressorts.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.001 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.001 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.001 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".