Validation of KIF1A/25B interactors in hereditary sensory and autonomic neuropathies type II
Bibliographic record
Abstract
Les neuropathies héréditaires sensitives et autonomes de type II (HSAN II) sont un groupe de maladies rares caractérisées par un mode de transmission autosomique récessif avec début à la naissance ou dans la petite enfance. Décrits pour la première fois en 1973 dans la population canadienne, ces patients présentent une force musculaire proche de la normale, une perte de proprioception (insensibilité à la douleur), une sensation de vibration et de pression, une diminution des réflexes cornéens, une aréflexie et une hypotonie sévère qui conduiront à une dysplasie osseuse, une scoliose, des articulations neuropathiques (Charcot) et des lésions cutanées compliquées souvent d'ostéomyélite mais néanmoins indolores. Toutes les modalités de la sensation (toucher-pression, vibration, froid, chaud et nociception) sont affectées. Des symptômes variables du dysfonctionnement de la composante autonome sont trouvés chez ces patients comme l'hyperhidrose, l'anhidrose inégale et le larmoiement retardé. Malheureusement, aucun traitement ne peut encore être proposé à ces patients et beaucoup reste à comprendre sur ses voies pathologiques.Ce projet vise à répondre aux questions concernant les interactions protéiques d'un gène causal identifié, KIF1A. Ce gène a été identifié par l'équipe du Dr Rouleau comme l'un des gènes causaux de HSAN II. L'isoforme est nommée HIF1A/25B car les mutations à l'origine de la maladie ont été exclusivement trouvées dans l'exon à épissage alternatif « 25B ». D'anciens étudiants du laboratoire de Dr Rouleau ont identifié une liste d'interacteurs protéiques de KIF1A/25B par spectrométrie de masse. Sur les cinquante-quatre interacteurs signalés comme ayant une interaction exclusive avec KIF1A/25B et 25B seuls, deux ont été sélectionnés en fonction de leur pertinence physiologique et de leur fonction connue : SYT11 (synaptotagmin XI) et CSNK1E (casein kinase 1 Epsilon). Ils ont confirmé que l'interaction de l'un d'entre eux, SYT11 via Co-immunoprécipitation (co-IP) était non exclusive avec 25B et nous avons également confirmé l'interaction de CSNK1E via co-IP et également non exclusive avec 25B
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.001 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.001 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.000 |
| Open science | 0.001 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.004 | 0.001 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".