Lack of SeqA focus formation, specific DNA binding and proper protein multimerization in the <i>Escherichia coli</i> sequestration mutant <i>seqA2</i>
Notice bibliographique
Résumé
In Escherichia coli wild-type cells newly formed origins cannot be reinitiated. The prevention of reinitiation is termed sequestration and is dependent on the hemimethylated state of newly replicated DNA. Several mutants discovered in a screen for the inability to sequester hemimethylated origins have been mapped to the seqA gene. Here, one of these mutants, seqA2, harbouring a single amino acid change in the C-terminal end of the SeqA protein, was found to also be unable to form foci in vivo. The SeqA foci seen in the wild-type cells are believed to arise from multimerization of SeqA on hemimethylated DNA at the replication fork, presumably representing organization of newly formed DNA by SeqA. The result suggests that the process of origin sequestration is closely tied to the process of focus maintenance at the replication fork. In vitro, purified SeqA2 protein was found incapable of forming highly ordered multimers that bind hemimethylated oriC. The mutant protein was also incapable of restraining negative supercoils. Both in vivo and in vitro results support the idea that origin sequestration is an integral part of organization of newly formed DNA performed by SeqA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».