Successful inhibition of Dnmt1 expression in bovine using RNA interference.
Notice bibliographique
Résumé
Epigenetic modifications, such as methylation are essential for normal mammalian development. Dnmt1 is the predominant and most active methylase, which is responsible for copying methylation patterns after replication. During early development, Dnmt1 is highly regulated to support passive demethylation and normal reprogramming. In somatic cells, Dnmt1 is localized in the nucleus and its introduction into cloned embryos is believed to be the main limiting factor for proper reprogramming of the donor genome. The aim of this study was to transiently suppress Dnmt1 by RNA interference (RNAi) to investigate the role of Dnmt1 during early development and its effect on nuclear transfer technology. RNA and protein extracts were collected from fibroblasts treated with control or Dnmt1 RNAi. Real time RT‐PCR revealed a 93.4% reduction of Dnmt1 transcript levels. Consistently, Western blot analysis showed a protein decrease of up to 98.8%. Gene expression of housekeeping genes, GAPD, ACTB and lamin A/C, were not affected after RNAi treatment however, expression of HPRT1, H19, MMP1 and SCYA genes was increased. This is the first report to demonstrate a specific and highly effective knockdown of bovine Dnmt1 by RNAi at both mRNA and protein levels. Dnmt1 RNAi could be a useful tool to better understand epigenetic reprogramming events as well as syndromes related to abnormal methylation patterns. (Funding by CONACyT & NSERC)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».