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Enregistrement W15836969 · doi:10.1096/fasebj.23.1_supplement.lb198

Successful inhibition of Dnmt1 expression in bovine using RNA interference.

2009· article· en· W15836969 sur OpenAlexafffund
Hector Eduardo Sosa, Jonathan LaMarre, Allan G. King

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaConsejo Nacional de Ciencia y Tecnología
Mots-clésRNA interferenceReprogrammingDNMT1BiologyGene knockdownEpigeneticsDNA methylationMethylationMolecular biologyGene expressionGene silencingSmall hairpin RNACell biologyGeneRNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epigenetic modifications, such as methylation are essential for normal mammalian development. Dnmt1 is the predominant and most active methylase, which is responsible for copying methylation patterns after replication. During early development, Dnmt1 is highly regulated to support passive demethylation and normal reprogramming. In somatic cells, Dnmt1 is localized in the nucleus and its introduction into cloned embryos is believed to be the main limiting factor for proper reprogramming of the donor genome. The aim of this study was to transiently suppress Dnmt1 by RNA interference (RNAi) to investigate the role of Dnmt1 during early development and its effect on nuclear transfer technology. RNA and protein extracts were collected from fibroblasts treated with control or Dnmt1 RNAi. Real time RT‐PCR revealed a 93.4% reduction of Dnmt1 transcript levels. Consistently, Western blot analysis showed a protein decrease of up to 98.8%. Gene expression of housekeeping genes, GAPD, ACTB and lamin A/C, were not affected after RNAi treatment however, expression of HPRT1, H19, MMP1 and SCYA genes was increased. This is the first report to demonstrate a specific and highly effective knockdown of bovine Dnmt1 by RNAi at both mRNA and protein levels. Dnmt1 RNAi could be a useful tool to better understand epigenetic reprogramming events as well as syndromes related to abnormal methylation patterns. (Funding by CONACyT & NSERC)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,176

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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