Structure-Function Relationship between the Human Chemokine Receptor CXCR3 and Its Ligands
Notice bibliographique
Résumé
I-TAC, IP10, and Mig are interferon-gamma inducible CXC chemokines that share the same G-protein-coupled receptor CXCR3, which is preferentially expressed on Th1 lymphocytes. We have explored the structure-function relationship of the CXCR3 ligands, in particular of I-TAC, which has highest affinity for CXCR3 and is the most potent agonist. A potent antagonist for CXCR3 was obtained by NH(2)-terminal truncation of I-TAC. I-TAC (4-73), which lacks the first three residues, has no agonistic activity but competes for the binding of I-TAC to CXCR3-bearing cells and inhibits migration and Ca(2+) changes in such cells in response to stimulation with I-TAC, IP10, and Mig. It does also not induce internalization of CXCR3, which is in support of the lack of agonistic effects. Hybrid chemokines between I-TAC and IP10 were used to identify regions responsible for the higher activity of I-TAC. I-TAC-like IP10 analogs are obtained by substituting the NH(2) terminus (residues 1-8) or N-loop region (residues 12-17) of IP10 with those of I-TAC, suggesting that the differences in function of the CXCR3 ligands can be assigned to distinct regions and that these regions are interchangeable. Structure-activity studies with Mig showed that the extended basic COOH-terminal region, which is not present in I-TAC and IP10, is important for binding and activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».