Structure-Function Relationship between the Human Chemokine Receptor CXCR3 and Its Ligands
Notice bibliographique
Résumé
I-TAC, IP10, and Mig are interferon-gamma inducible CXC chemokines that share the same G-protein-coupled receptor CXCR3, which is preferentially expressed on Th1 lymphocytes. We have explored the structure-function relationship of the CXCR3 ligands, in particular of I-TAC, which has highest affinity for CXCR3 and is the most potent agonist. A potent antagonist for CXCR3 was obtained by NH(2)-terminal truncation of I-TAC. I-TAC (4-73), which lacks the first three residues, has no agonistic activity but competes for the binding of I-TAC to CXCR3-bearing cells and inhibits migration and Ca(2+) changes in such cells in response to stimulation with I-TAC, IP10, and Mig. It does also not induce internalization of CXCR3, which is in support of the lack of agonistic effects. Hybrid chemokines between I-TAC and IP10 were used to identify regions responsible for the higher activity of I-TAC. I-TAC-like IP10 analogs are obtained by substituting the NH(2) terminus (residues 1-8) or N-loop region (residues 12-17) of IP10 with those of I-TAC, suggesting that the differences in function of the CXCR3 ligands can be assigned to distinct regions and that these regions are interchangeable. Structure-activity studies with Mig showed that the extended basic COOH-terminal region, which is not present in I-TAC and IP10, is important for binding and activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».