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Enregistrement W1995858368 · doi:10.1021/jo901616p

How the Substituent at O-3 of <i>N</i>-Acetylglucosamine Impacts Glycosylation at O-4: A Comparative Study

2009· article· en· W1995858368 sur OpenAlexaff
Jenifer L. Hendel, Jo-Wen Wang, Trudy A. Jackson, Karolyn Hardmeier, Richelle De Los Santos, France‐Isabelle Auzanneau

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Organic Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryTrisaccharideDisaccharideN-AcetylglucosamineResidue (chemistry)GlycosylationAcceptorSubstituentReactivity (psychology)StereochemistryOrganic chemistryEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An assessment of the relative reactivities of the 4-OH of N-acetylglucosamine acceptors bearing simple protecting groups, beta-linked or alpha-linked D or L sugars at O-3 is presented, using a per-O-acetylated alpha-D-glucosyl trichloroacetimidate donor under activation by BF(3) x OEt(2). The presence of either an acyl or carbonate protecting group at O-3 did not impact the reactivity at O-4 with all glycosylations proceeding successfully. On the other hand, the presence of peracetylated sugars at O-3 of N-acetylglucosamine acceptors did impact the reactivity of the 4-OH. The acceptors with an alpha-D-Man, beta-D-Gal, or beta-D-Glc at O-3 reacted promptly. In comparison, the acceptors bearing a beta-L-Fuc, alpha-L-Fuc, or alpha-L-Rha underwent glucosylation slowly, and unreacted acceptor was recovered from the reaction mixtures. Systematic searches carried out on the disaccharide acceptors and trisaccharide products carrying either a peracetylated beta-D-Gal or beta-L-Fuc at O-3 of the glucosamine residue suggest that, for these two acceptors, a conformational reorientation necessary around the fucosidic linkage contributes to the lower reactivity of the beta-fucosylated acceptor. The acceptors bearing a beta-linked D-Gal, D-Glc, or L-Fuc residue at O-3 each gave trisaccharide products that were mostly stable in the reaction conditions. In contrast, the alpha-linked residues at O-3 were rather unstable in these reaction conditions and the degradation of either the acceptors or trisaccharide products led to low glycosylation yields. In these later reactions, it was impossible to clearly assess which of the acceptor or product underwent degradation as comigration and detection issues prevented us from following these glycosylations by TLC or RP-HPLC. In contrast, the glycosylation of an acceptor carrying an alpha-linked perbenzylated L-Fuc residue at O-3 could be easily monitored by RP-HPLC. The data obtained when monitoring this glycosylation showed that the acceptor underwent prompt glycosylation but a decrease in the absorbance peak corresponding to the trisaccharide along with the appearance of a peak corresponding to a perbenzylated fucose hemiacetal indicated that the trisaccharide product was unstable in the reaction conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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