Topological analysis and role of the transmembrane domain in polar targeting of PilS, a <i>Pseudomonas aeruginosa</i> sensor kinase
Notice bibliographique
Résumé
In Pseudomonas aeruginosa, synthesis of pilin, the major protein subunit of the pili, is regulated by a two-component signal transduction system in which PilS is the sensor kinase. PilS is an inner membrane protein found at the poles of the bacterial cell. It is composed of three domains: an N-terminal hydrophobic domain; a central cytoplasmic linker region; and the C-terminal transmitter region conserved among other sensor kinases. The signal that activates PilS and, consequently, pilin transcription remains unknown. The membrane topology of the hydrophobic domain was determined using the lacZ and phoA gene fusion approach. In this report, we describe a topological model for PilS in which the hydrophobic domain forms six transmembrane helices, whereas the N- and C-termini are cytoplasmic. This topology is very stable, and the cytoplasmic C-terminus cannot cross the inner membrane. We also show that two of the six transmembrane segments are sufficient for membrane anchoring and polar localization of PilS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».