Phenotypic changes associated with deletion and overexpression of a stage-regulated gene family in Leishmania
Notice bibliographique
Résumé
The LmcDNA16 locus of Leishmania major contains three highly related genes HASPA1, HASPA2 and HASPB, encoding hydrophilic, acylated surface proteins and a tandem pair of unrelated sequences, SHERP1 and SHERP2, coding for a small, hydrophilic protein that localizes to the endoplasmic reticulum and outer mitochondrial membrane. Differential regulation of these genes results in expression of a subset of the HASP proteins and SHERP only in infective stage parasites. To assess the contribution of these molecules to parasite virulence, the diploid LmcDNA16 gene locus has been removed by targeted gene deletion. Homozygous null mutants have precise deletions of both alleles and exhibit no HASP or SHERP expression. They are at least as virulent as wild-type parasites in macrophage invasion and intracellular survival assays, both in vitro and in vivo. Conversely, null mutants engineered to overexpress the entire LmcDNA16 gene locus are unable to survive within the intramacrophage environment despite their differentiation into infective metacyclic parasites. Both null and overexpressing null parasites show increased sensitivity to complement-mediated lysis, suggesting perturbation of their surface architecture. Avirulence in overexpressing parasites correlates with selective depletion of a specific lipid species, decreased expression of the major surface glycoprotein GP63, but no significant downregulation of the glycoconjugate lipophosphoglycan.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».