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Enregistrement W2037835662 · doi:10.1034/j.1399-3011.2002.21024.x

An artificial peptide with corticotropin‐releasing factor receptor‐2 (CRF‐R2) selective properties: the role of primary structure in the induction of signal transduction pathways

2002· article· en· W2037835662 sur OpenAlexaff
David J Tellam, David A. Lovejoy, D Smart, Xing Qian

Notice bibliographique

RevueJournal of Peptide Research · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueStress Responses and Cortisol
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChinese hamster ovary cellBiologyReceptorPeptide sequencePeptideBiochemistryGeneUrocortinMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Considerable plasticity can occur within the amino acid sequence of amphiphilic peptide hormones. This is particularly evident within the corticotropin-releasing factor (CRF) family of peptides where, despite less than 15% sequence similarity among the four paralogous lineages, all are capable of acting as high affinity ligands to members of the CRF receptor family. This suggests that these peptides could undergo many mutational changes and remain as high affinity ligands to their receptors as long as the functional motifs do not change radically. Because paralogous peptide lineages are a product of genome duplications, additional genes encoding peptide-like sequences, which through mutation have lost their functional integrity, may exist. Function to these sequences may be restored if the appropriate motifs are reinserted into the primary structure. We screened rat genomic DNA with highly degenerate polymerase chain reaction (PCR) primers targeted to hybridize with the termini of CRF-related sequences. One set of sauvagine-based primers hybridized with a 120-bp sequence. The theoretical peptide sequence (SV4) showed similarity to the CRF family of peptides at the primary structure level. The encoded sequence was prepared by solid-phase synthesis and its activity assayed against mouse R1 and human R1/R2 receptors. SV4 did not bind to either mouse or human variants of the R1 receptor, but did bind to the R2 receptor with an affinity comparable to human CRF. SV4 exhibited a similar efficacy of cellular activation as CRF in trials quantifying the acidification rate of human R2alpha-transfected Chinese hamster ovary (CHO) cells, but not R1-transfected cells. SV4 utilizes adenylate cyclase as the principal secondary messenger of R2 signal transduction but, unlike urocortin or sauvagine, does not activate guanylate cyclase-, calcium- or mitogen-activated protein (MAP) kinase-mediated pathways. These data suggest that this artificial peptide may be useful to understand the cyclic adenosine monophosphate (cAMP)-dependent component of the CRF-R2 signal transduction cascade, and that additional sequences in the genome may be used to engineer bioactive peptides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,534

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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