Studies of Protein−DNA Interactions by Capillary Electrophoresis/Laser-Induced Fluorescence Polarization
Notice bibliographique
Résumé
Protein-DNA interactions were studied on the basis of capillary electrophoretic separation of bound from free fluorescent probe followed by on-line detection with laser-induced fluorescence polarization. Changes in electrophoretic mobility and fluorescence anisotropy upon complex formation were monitored for the determination of binding affinity and stoichiometry. The method was applied to study the interactions of single-stranded DNA binding protein (SSB) with synthetic oligonucleotides and single-stranded DNA. Increases in fluorescence anisotropy and decreases in electrophoretic mobility upon their binding to SSB were observed for the fluorescently labeled 11-mer and 37-mer oligonucleotide probes. Fluorescence anisotropy and electrophoretic mobility were used to determine the binding constants of the SSB with the 11-mer (5 x 10(6) M(-1)) and the 37-mer (23 x 10(6) M(-1)). Alternatively, a fluorescently labeled SSB was used as a probe, and the formation of multiple protein-DNA complexes that differ in stoichiometry was observed. The results demonstrate the applicability of the method to study complex interactions between protein and DNA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».