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Enregistrement W2054194083 · doi:10.1021/tx6002968

Near-UV Photolysis of 2-Methyl-1,4-naphthoquinone−DNA Duplexes:  Characterization of Reversible and Stable Interstrand Cross-Links between Quinone and Adenine Moieties

2007· article· en· W2054194083 sur OpenAlexaff
François Bergeron, Klaus Klarskov, Darel J. Hunting, J. Richard Wagner

Notice bibliographique

RevueChemical Research in Toxicology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMoietyChemistryDeprotonationPhotodissociationRadicalProtonationDNAStereochemistryAdductPhotochemistryOrganic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Near-UV photolysis of 2-methyl-1,4-naphthoquinone (MQ, menadione) tethered DNA induces initial charge transfer followed by either transport of the damage to G or the formation of interstrand cross-links between MQ and DNA bases. In this work, the products responsible for interstrand cross-links have been characterized by mass spectrometry, NMR, and comparison with model compounds. Three major products were formed in the photolysis of MQ-DNA duplexes. Two of the products (isomers) have a cross-link between C2 of a 2,3-saturated MQ moiety and N6 of a dAdo moiety. These products readily convert back to MQ and dAdo upon heating in neutral solution, and thus, they lead to reversible cross-links in MQ-DNA duplexes. The third product has a cross-link between C3 of a 2,3-unsaturated MQ moiety and N6 of an dAdo moiety. This product was stable in neutral solution. The formation of MQ to A cross-links in DNA may be explained by the coupling of MQ radicals that arise from the protonation of MQ radical anions, together with adenin-N6-yl radicals that arise from the deprotonation of A radical cations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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