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Enregistrement W2064732371 · doi:10.1021/bi002331u

Requirements for Osmosensing and Osmotic Activation of Transporter ProP from<i>Escherichia coli</i>

2001· article· en· W2064732371 sur OpenAlexaff
Kathleen I. Racher, Doreen E. Culham, Janet M. Wood

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOsmolyteChemistryOsmotic shockOsmotic pressureProlineSymporterBiochemistryBiophysicsOsmotic concentrationPEG ratioHofmeister seriesTransporterEscherichia coliMembrane potentialBiologyIonAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transporter ProP of Escherichia coli, a solute-H+ symporter, can sense and respond to osmotic upshifts imposed on cells, on membrane vesicles, or on proteoliposomes that incorporate purified ProP-(His)6. In this study, proline uptake catalyzed by ProP was used as a measure of its osmotic activation, and the requirements for osmosensing were defined using the proteoliposome system. The initial rate of proline uptake increased with decreasing external pH and increasing DeltaPsi, lumen negative. Osmotic upshifts increased DeltaPsi by concentrating lumenal K+, but osmotic activation of ProP could be distinguished from this effect. Osmotic activation of ProP resulted from changes in Vmax, though osmotic shifts also increased the KM for proline. Osmotic activation could be described as a reversible, osmotic upshift-dependent transition linking (at least) two transporter protein conformations. No correlation was observed between ProP activation and the position of the anions of activating sodium salts within the Hofmeister series of solutes. Both the magnitude of the osmotic upshift required to activate ProP and the ProP activity attained were similar for membrane-impermeant osmolytes, including NaCl, glucose, and PEG 600. The membrane-permeant osmolytes glycerol, urea, PEG 62, and PEG 106 failed to activate ProP. Two poly(ethylene glycol)s, PEG 150 and PEG 200, were membrane-permeant and did not cause liposome shrinkage, but they did partially activate ProP-(His)6.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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