Autoprocessing of the Escherichia coli AIDA-I Autotransporter
Notice bibliographique
Résumé
The cleavage of the autotransporter adhesin involved in diffuse adherence (AIDA-I) of Escherichia coli yields a membrane-embedded fragment, AIDAc, and an extracellular fragment, the mature AIDA-I adhesin. The latter remains noncovalently associated with AIDAc but can be released by heat treatment. In this study we determined the mechanism of AIDA-I cleavage. We showed that AIDA-I processing is an autocatalytic event by monitoring the in vitro cleavage of an uncleaved mutant protein isolated from inclusion bodies. Furthermore, by following changes in circular dichroism spectra and protease resistance of the renaturated protein, we showed that the cleavage of the protein is correlated with folding. With site-directed deletions, we showed that the catalytic activity of the protein lies in a region encompassing amino acids between Ala-667 and Thr-953, which includes the conserved junction domain of some autotransporters. With site-directed point mutations, we also found that Asp-878 and Glu-897 are involved in the processing of AIDA-I and that a mutation preserving the acidic side chain of Asp-878 was tolerated, giving evidence that this carboxylic acid group is directly involved in catalysis. Last, we confirmed that cleavage of AIDA-I is intramolecular. Our results unveil a new mechanism of auto-processing in the autotransporter family.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».