MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2068146127 · doi:10.1094/pdis.2000.84.7.731

Implications of Sexual Reproduction for <i>Phytophthora infestans</i> in the United States: Generation of an Aggressive Lineage

2000· article· en· W2068146127 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDuPont
Mots-clésBiologyPhytophthora infestansMating typeGeneticsHaplotypeLocus (genetics)Restriction fragment length polymorphismSexual reproductionMetalaxylAlleleLineage (genetic)GenotypeGenetic diversityBotanyGenePopulationFungicide

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phytophthora infestans isolates (n = 26) collected in the Columbia Basin of Oregon and Washington in 1993, which had been characterized previously for mating type, metalaxyl sensitivity, and alleles at the glucose-6-phosphate isomerase locus, were analyzed for nuclear restriction fragment length polymorphism (RFLP) bands detected by probe RG57 and mitochondrial haplotype. Analyses involving the larger set of markers indicated that this group of isolates satisfied expectations of a sexual progeny: they contained much greater genetic diversity than has been reported for most other epidemic populations of P. infestans in the United States and Canada (16 unique multilocus genotypes); both mating types were present in proximity; all possible combinations of alleles occurred at many pairs of polymorphic loci; and two distinct mitochondrial haplotypes were distributed among the isolates. An in vitro laboratory cross involving the putative parents (US-6 and US-7) as parental strains produced progeny with the same general characteristics as the field isolates. Among the field progeny were two genotypes, US-11 and US-16, that had been described previously but from subsequent and largely clonal collections. Isolates obtained from tomatoes (n = 40) and potatoes (n = 7) in 24 counties in California in 1998 were analyzed as described above, and all except one US-8 isolate from potatoes were of the US-11 clonal lineage, consistent with the hypothesis that the US-11 lineage is an especially fit clonal lineage that has survived over time and can dominate pathogen populations over a large area. We conclude that the 1993 Columbia Basin collection represents a sexual progeny that generated the US-11 lineage, and that this lineage is particularly fit when tomatoes are part of the agroecosystem.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,955
Score d'incertitude au seuil0,078

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle