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Enregistrement W2068417296 · doi:10.1042/bj20020768

A re-evaluation of the role of histidine-426 within Pseudomonas aeruginosa exotoxin A

2002· article· en· W2068417296 sur OpenAlexafffund
Tania Michelle Roberts, A. Rod Merrill

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueToxin Mechanisms and Immunotoxins
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPseudomonas aeruginosaPseudomonas exotoxinHistidineMicrobiologyExotoxinBiologyChemistryBacteriaBiochemistryGeneticsAmino acidToxin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CRM66 (cross-reactive 66 kDa protein) is an inactive mutant form of Pseudomonas aeruginosa exotoxin A that has been isolated from a mutant strain of P. aeruginosa derived from nitrosoguanidine-based mutagenesis. The mutation within this enzyme toxin was previously identified as H426Y and it was shown to possess significantly reduced enzymic activity. Furthermore, it was previously suggested that His-426 may directly participate in the catalytic mechanism of the exotoxin A enzyme and that it may also play an important role in the binding of the protein substrate of exotoxin A, a critical protein factor in eukaryotic protein translation known as elongation factor-2. In order to more thoroughly characterize the role of His-426 in the enzyme mechanism of exotoxin A, amino acid substitutions were made within helix 1 of the enzyme domain in the vicinity of the His-426 residue. Analysis of the site-directed mutagenesis results involving kinetic and protein structural integrity measurements revealed that His-426 H-bonds to Tyr-502 and that replacement of His-426 with polar substitutions leads to structural alterations of the enzyme's folded conformation. Furthermore, it was shown that His-426 is not important for the binding of either of the two substrates of exotoxin A, NAD(+) or elongation factor-2. In summary, these data show that His-426 is not an active-site residue and that it is not important for substrate binding or orientation, but that it plays an important structural role in helping to maintain the folded conformation of the enzyme toxin. Therefore, the role of His-426 would seem to be to tether helix 1 to the main body of the enzyme, and mutations resulting in the disruption of this region of the enzyme result in a significantly impaired enzyme.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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