MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2080231296 · doi:10.3109/07420528.2012.691145

Chronomics of Pressure Overload–Induced Cardiac Hypertrophy in Mice Reveals Altered Day/Night Gene Expression and Biomarkers of Heart Disease

2012· article· en· W2080231296 sur OpenAlex
Elena V. Tsimakouridze, Marty Straume, Peter Podobed, Heather Chin, Jonathan LaMarre, Ron J. Johnson, Monica Antenos, Gordon M. Kirby, Allison Mackay, P. Huether, Jeremy A. Simpson, Michael J. Sole, Gerard Gadal, Tami A. Martino

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueChronobiology International · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesU.S. Public Health Service
Mots-clésDiseaseGene expression profilingGene expressionPressure overloadReal-time polymerase chain reactionMuscle hypertrophyLeft ventricular hypertrophyCircadian rhythmMicroarrayMedicineDNA microarrayBiomarkerHeart diseaseBioinformaticsInternal medicineGeneBiologyBlood pressureEndocrinologyCardiac hypertrophyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is critical demand in contemporary medicine for gene expression markers in all areas of human disease, for early detection of disease, classification, prognosis, and response to therapy. The integrity of circadian gene expression underlies cardiovascular health and disease; however time-of-day profiling in heart disease has never been examined. We hypothesized that a time-of-day chronomic approach using samples collected across 24-h cycles and analyzed by microarrays and bioinformatics advances contemporary approaches, because it includes sleep-time and/or wake-time molecular responses. As proof of concept, we demonstrate the value of this approach in cardiovascular disease using a murine Transverse Aortic Constriction (TAC) model of pressure overload-induced cardiac hypertrophy in mice. First, microarrays and a novel algorithm termed DeltaGene were used to identify time-of-day differences in gene expression in cardiac hypertrophy 8 wks post-TAC. The top 300 candidates were further analyzed using knowledge-based platforms, paring the list to 20 candidates, which were then validated by real-time polymerase chain reaction (RTPCR). Next, we tested whether the time-of-day gene expression profiles could be indicative of disease progression by comparing the 1- vs. 8-wk TAC. Lastly, since protein expression is functionally relevant, we monitored time-of-day cycling for the analogous cardiac proteins. This approach is generally applicable and can lead to new understanding of disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,220
Score d'incertitude au seuil0,471

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle