Characterization of a cGMP-Response Element in the Guanylyl Cyclase/Natriuretic Peptide Receptor A Gene Promoter
Notice bibliographique
Résumé
Previous studies have shown that atrial natriuretic peptide (ANP) can inhibit transcription of its receptor, guanylyl cyclase A, by a mechanism dependent on cGMP and have suggested the presence of a putative cGMP-response element (cGMP-RE) in the Npr1 gene promoter. To localize and characterize the putative cis-acting element, we have subcloned a 1520-bp fragment of the rat Npr1 promoter in an expression vector containing the luciferase reporter gene. Several fragments, generated by exonuclease III-directed deletions, were transiently transfected into cells to measure their promoter activity. Deletion from -1520 to -1396 of a 1520-bp-long Npr1 promoter led to a 5-fold increase in luciferase activity. Subsequent deletion to the position -1307 resulted in a decrease of luciferase activity by 90%. Preincubation of cells with 100 nM of ANP or 100 microM 8-bromo-cGMP inhibited luciferase activity of the 1520-bp and 1396-bp-long fragments, but not the activity of the 1307-bp fragment, suggesting that the cGMP-RE is localized between positions -1396 and -1307. The cGMP regulatory region was narrowed by gel shift assays and footprinting to position -1372 to -1354 from the transcription start site of Npr1 and indicated its interaction with transcriptional factor(s). Cross-competition experiments with mutated oligonucleotides led to the definition of a consensus sequence (-1372 AaAtRKaNTTCaAcAKTY -1354) for the novel cGMP-RE, which is conserved in the human (75% identity) and mouse (95% identity) Npr1 promoters.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».