Characterization of a cGMP-Response Element in the Guanylyl Cyclase/Natriuretic Peptide Receptor A Gene Promoter
Notice bibliographique
Résumé
Previous studies have shown that atrial natriuretic peptide (ANP) can inhibit transcription of its receptor, guanylyl cyclase A, by a mechanism dependent on cGMP and have suggested the presence of a putative cGMP-response element (cGMP-RE) in the Npr1 gene promoter. To localize and characterize the putative cis-acting element, we have subcloned a 1520-bp fragment of the rat Npr1 promoter in an expression vector containing the luciferase reporter gene. Several fragments, generated by exonuclease III-directed deletions, were transiently transfected into cells to measure their promoter activity. Deletion from -1520 to -1396 of a 1520-bp-long Npr1 promoter led to a 5-fold increase in luciferase activity. Subsequent deletion to the position -1307 resulted in a decrease of luciferase activity by 90%. Preincubation of cells with 100 nM of ANP or 100 microM 8-bromo-cGMP inhibited luciferase activity of the 1520-bp and 1396-bp-long fragments, but not the activity of the 1307-bp fragment, suggesting that the cGMP-RE is localized between positions -1396 and -1307. The cGMP regulatory region was narrowed by gel shift assays and footprinting to position -1372 to -1354 from the transcription start site of Npr1 and indicated its interaction with transcriptional factor(s). Cross-competition experiments with mutated oligonucleotides led to the definition of a consensus sequence (-1372 AaAtRKaNTTCaAcAKTY -1354) for the novel cGMP-RE, which is conserved in the human (75% identity) and mouse (95% identity) Npr1 promoters.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».