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Enregistrement W2091345530 · doi:10.1161/01.hyp.0000126920.93207.53

Characterization of a cGMP-Response Element in the Guanylyl Cyclase/Natriuretic Peptide Receptor A Gene Promoter

2004· article· en· W2091345530 sur OpenAlexafffund
David Hum, Sandrine Besnard, Rocío Sánchez, Dominic Devost, Françis Gossard, Pavel Hamet, Johanne Tremblay

Notice bibliographique

RevueHypertension · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHeart Failure Treatment and Management
Établissements canadiensHôtel-Dieu de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLuciferasePromoterNPR1Transcription (linguistics)Molecular biologyReporter geneResponse elementNPR2BiologyGeneTranscription factorAtrial natriuretic peptideReceptorTransfectionChemistryNatriuretic peptideGene expressionBiochemistryInternal medicineEndocrinologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have shown that atrial natriuretic peptide (ANP) can inhibit transcription of its receptor, guanylyl cyclase A, by a mechanism dependent on cGMP and have suggested the presence of a putative cGMP-response element (cGMP-RE) in the Npr1 gene promoter. To localize and characterize the putative cis-acting element, we have subcloned a 1520-bp fragment of the rat Npr1 promoter in an expression vector containing the luciferase reporter gene. Several fragments, generated by exonuclease III-directed deletions, were transiently transfected into cells to measure their promoter activity. Deletion from -1520 to -1396 of a 1520-bp-long Npr1 promoter led to a 5-fold increase in luciferase activity. Subsequent deletion to the position -1307 resulted in a decrease of luciferase activity by 90%. Preincubation of cells with 100 nM of ANP or 100 microM 8-bromo-cGMP inhibited luciferase activity of the 1520-bp and 1396-bp-long fragments, but not the activity of the 1307-bp fragment, suggesting that the cGMP-RE is localized between positions -1396 and -1307. The cGMP regulatory region was narrowed by gel shift assays and footprinting to position -1372 to -1354 from the transcription start site of Npr1 and indicated its interaction with transcriptional factor(s). Cross-competition experiments with mutated oligonucleotides led to the definition of a consensus sequence (-1372 AaAtRKaNTTCaAcAKTY -1354) for the novel cGMP-RE, which is conserved in the human (75% identity) and mouse (95% identity) Npr1 promoters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,419
Score d'incertitude au seuil0,321

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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